正在诉讼的公司一般不可以直接注销，但若妥善处理诉讼事宜并遵循法定程序，则可以进行注销。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律程序角度
诉讼未了结时注销的后果：
- 在诉讼过程中，公司作为诉讼当事人，其主体资格在法律程序中有重要意义。若在诉讼未了结时注销公司，可能导致诉讼程序无法正常进行，损害债权人或其他诉讼当事人的合法权益。
- 例如，若公司作为被告，在诉讼未终结时注销，原告可能面临无法追偿的风险，因为被告主体已不存在。
注销前的清算程序：
- 公司注销需经过一系列法定程序，如清算等。在清算过程中，应将诉讼相关的债权债务进行清理和处置。
- 清算组应在成立之日起10日内通知债权人，并于60日内在报纸上公告。债权人需在接到通知书之日起30日内，未接到通知书的自公告之日起45日内，向清算组申报债权。
- 对于诉讼相关事宜，清算组需代表公司参与诉讼，处理涉及公司的未了结业务，包括在诉讼中主张权利和履行义务。
二、法律责任角度
未经依法清算即注销的责任：
- 若公司未经依法清算即办理注销登记，导致公司无法进行清算，债权人主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任的，人民法院应依法予以支持。
- 例如，若公司注销后，发现存在未清偿的债务，债权人可以起诉原公司股东，要求其在接收公司财产范围内承担清偿责任。
注销后诉讼主体资格的消灭：
- 因公司注销导致诉讼主体资格消灭，若诉讼尚未审结，法院可能会裁定终结诉讼，告知债权人另行起诉相关责任主体。
- 这意味着，若公司未妥善处理诉讼事宜即注销，可能导致债权人无法通过原诉讼程序追偿，而需另行提起诉讼，增加了债权人的维权成本。
三、实际操作建议
妥善处理诉讼事宜：
- 若公司正处于诉讼阶段，应在注销前将诉讼案件处理完毕，包括达成和解、获得判决等。否则，可能会影响注销程序的进行。
- 例如，公司可以与原告协商达成和解协议，并履行完毕和解协议中的义务，以确保诉讼终结。
遵循法定程序进行注销：
- 公司应依法进行清算，编制资产负债表和财产清单，处理好剩余财产等，并按照法定程序依次清偿债务，办理税务注销、工商注销等手续。
- 在清算过程中，公司应确保诉讼相关的债权债务得到妥善处理，以避免后续法律纠纷。
总结与建议：
正在诉讼的公司一般不可以直接注销，但若公司能够妥善处理诉讼事宜并遵循法定程序进行清算和注销，则可以进行注销。在实际操作中，公司应密切关注诉讼进展，确保在注销前将诉讼案件处理完毕，并遵循法定程序进行清算和注销。若公司存在未经依法清算即注销等违法行为，可能面临法律责任。因此，建议公司在注销前咨询专业律师，以确保合法合规完成注销程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。