案件移交到检察院后，若检察院决定不起诉，通常情况下是不会留下案底的。以下从不同角度进行详细分析：

一、不起诉的类型及是否留案底

1. 法定不起诉

   • 适用情形：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，对于情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；以及其他法律规定免予追究刑事责任的情形，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪。
   • 是否留案底：由于这些情形下犯罪嫌疑人的行为不被认定为犯罪或依法不需追究刑事责任，因此不会留下案底。

2. 酌定不起诉

   • 适用情形：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条第二款，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。例如，犯罪嫌疑人在犯罪后有自首、立功表现，或者积极赔偿被害人损失并取得谅解等。
   • 是否留案底：尽管行为构成犯罪，但因情节轻微等原因不需判处刑罚，检察院作出酌定不起诉后，通常也不会留下案底，旨在给予犯罪嫌疑人改过自新的机会。

3. 存疑不起诉

   • 适用情形：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条第四款，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
   • 是否留案底：因证据不足而无法认定犯罪嫌疑人有罪，故不会留下案底。

二、特殊情况与注意事项

• 行政违法记录：虽然检察院的不起诉决定本身不产生犯罪记录，但若行为涉及行政违法，可能会留下行政处罚记录。例如，因打架斗殴被行政拘留，即使检察院不起诉，行政拘留的记录仍然会存在。
• 特定行业或职业影响：在某些行业或职业中，即使检察院作出不起诉决定，相关单位可能根据内部规定进行一定处理或记录。例如，教师因涉嫌犯罪被检察院不起诉，但学校可能根据内部规定对其进行处分或解聘。但这与法律意义上的案底不同。
• 后续情况变化：若后续出现新证据或情况发生变化，导致案件重新进入司法程序并被法院判决有罪，则将留下犯罪记录。例如，检察院作出不起诉决定后，又发现了新的证据证明犯罪嫌疑人有罪，此时案件可能会重新进入司法程序，并被法院判决有罪，从而留下案底。

三、建议与总结

• 了解法律规定：在处理刑事案件时，应充分了解并遵循相关法律规定，以确保当事人的合法权益得到保障。
• 咨询专业律师：如果你对此类法律问题存在疑虑或担忧，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。
• 总结：案件移交到检察院后，若检察院决定不起诉，通常情况下是不会留下案底的。但具体情况还需结合案件的具体事实和法律规定来判断。因此，在处理刑事案件时，务必谨慎对待每一个环节，确保自己的合法权益不受侵害。