针对您提出的“房产过户协议好了怎么在法院判决”的问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

首先，要明确的是，房产过户协议本身并不直接由法院判决。通常，房产过户协议是双方自愿达成的关于房产所有权转移的约定。然而，如果这一协议在履行过程中发生争议，或者双方无法就协议内容达成一致，那么可能会涉及到法院诉讼。

在涉及房产过户的法院诉讼中，法院会根据双方提供的证据、法律规定以及案件的具体情况，对房产的所有权作出明确的裁定。这一裁定可能包括确认房产的归属、要求一方协助另一方办理过户手续、或者对违约方进行处罚等。

如果法院作出了有利于您的裁定，并且裁定中明确指出了房产应过户给您，那么您可以依据这一裁定前往房地产主管部门申请房产过户业务。在申请过程中，您需要提供法院作出的裁定文书、双方的身份证明、房产证明等相关材料。

值得注意的是，虽然房产过户在特定情况下（如离婚房产过户）可能无需负担额外的个人所得税及契税等相关费用，但具体费用仍需根据当地房地产管理部门的规定来确定。因此，在办理过户手续前，建议您先咨询当地房地产管理部门或相关律师，了解具体的费用标准和办理流程。

最后，根据《民事诉讼法》的相关规定，如果一方拒绝履行法院作出的裁定，对方当事人可以向人民法院申请执行。在执行过程中，人民法院可以向有关单位发出协助执行通知书，要求有关单位协助办理财产权证照转移手续。因此，如果遇到对方不配合办理过户的情况，您可以依法向人民法院申请强制执行。

综上所述，房产过户协议本身并不直接由法院判决，但如果协议发生争议或无法履行，可以通过法院诉讼来解决。在获得法院有利于您的裁定后，您可以依据裁定前往房地产主管部门办理过户手续。如果遇到对方不配合的情况，还可以依法申请强制执行。