非法占用农用地罪确实适用于企业。以下是对这一结论的详细阐述：

一、法律依据

根据《中华人民共和国刑法》第三百四十二条的规定，非法占用农用地罪是指违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的行为。该法条并未将犯罪主体限定为自然人，因此，企业作为单位，若实施上述行为，同样可能构成此罪。

二、犯罪构成

1. 主体：本罪的主体既可以是自然人，也可以是单位，包括公司、企业、事业单位等。
2. 主观方面：表现为故意，即明知占用农用地会改变土地用途，且可能造成农用地大量毁坏，仍实施该行为。
3. 客体：侵犯的是国家的土地管理制度，特别是耕地、林地等农用地的保护制度。
4. 客观方面：表现为违反土地管理法规，非法占用农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成农用地大量毁坏的行为。

三、法律责任

1. 对于自然人犯此罪的，将处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
2. 对于单位犯此罪的，根据《中华人民共和国刑法》第三百四十六条的规定，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前述规定处罚。

四、实际案例

在实际司法实践中，不乏企业因非法占用农用地而被追究刑事责任的案例。这些案例通常涉及企业未经批准擅自占用耕地、林地等农用地进行非农业建设，如建设厂房、开采矿产等，且数量较大，造成了农用地的大量毁坏。

综上所述，非法占用农用地罪确实适用于企业。企业应严格遵守土地管理法规，不得非法占用农用地进行非农业建设，以免触犯法律并承担相应的刑事责任。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。