已查封的房产不能办理产权证。以下是对此结论的详细解释：
法律规定：
- 根据《不动产登记暂行条例》第二十二条，存在尚未解决的权属争议或法律、行政法规规定不予登记的其他情形的，不动产登记机构应当不予登记。被查封的房产属于权属受限状态，符合上述不予登记的情形。
- 《中华人民共和国城市房地产管理法》第三十八条也明确规定，司法机关和行政机关依法裁定、决定查封的房地产，不得转让。由于产权证的办理涉及房产权利的转移或确认，因此已查封的房产不符合办理条件。
查封目的与实际操作：
- 司法机关查封房产的目的是为了限制房产所有人对房产的处分权，确保案件处理过程中房产不被转移或变卖，从而保障未来生效法律文书的顺利执行。允许查封期间办理产权证将破坏这一目的，可能损害债权人或其他利害关系人的合法权益。
- 在实际操作中，法院查封房屋时会通知不动产登记机构禁止办理相关产权登记。这意味着任何试图在查封期间办理产权证的行为都将因法院的查封指令而被拒绝。
特殊情况处理：
- 在某些特殊情况下，如查封房产的案件最终处理结果明确且不影响查封目的实现，同时得到相关司法机关或有权部门的同意，可能会考虑办理产权证。但这需要严格遵循法定程序和审批要求，且情况较为罕见。
- 如果查封、扣押、冻结协助执行通知书在送达登记机关时，登记机关已经受理了过户登记申请但尚未完成登记，应协助人民法院执行。然而，这并不意味着可以完成产权证的办理，而是需按照法院的要求进行相应处理。
综上所述，已查封的房产由于法律上的限制和实践操作中的障碍，不能办理产权证。如果您面临此类情况，建议咨询专业律师以了解具体的法律后果和可能的解决方案。