针对您提出的“公司说多发了工资要求退还，员工已经签了协议”这一问题，以下是我的详细分析和建议：
一、核心结论
- 若协议合法有效且内容明确：员工通常需要按照协议约定退还多发的工资。
- 若协议存在瑕疵或违法情形：员工可能无需退还或可部分退还多发工资，并可考虑通过法律途径维护自身权益。
二、详细分析
1. 协议合法有效且内容明确的情况
- 法律效果：一旦员工签署了退还多发工资的协议，且该协议内容明确、合法有效，那么员工就应当按照协议约定履行退还义务。这是因为协议是双方自愿达成的合意，具有法律约束力。
- 建议：在这种情况下，员工应认真核对协议内容，确保自己理解并同意其中的条款。如果确实存在多发工资的情况，且协议内容合理，那么员工应按照协议约定及时退还多发工资，以避免可能的法律纠纷。
2. 协议存在瑕疵或违法情形的情况
- 法律效果：如果协议存在瑕疵（如签署时受到胁迫、欺诈等）或违法情形（如违反法律法规的强制性规定），那么该协议可能被视为无效或可撤销。在这种情况下，员工可能无需退还或可部分退还多发工资。
- 具体分析：
- 瑕疵协议：如果员工在签署协议时受到胁迫、欺诈等不正当手段的影响，导致签署了并非自己真实意愿的协议，那么员工可以在法定期限内请求法院或仲裁机构撤销该协议。撤销后，员工无需按照原协议履行退还义务。
- 违法协议：如果协议内容违反了法律法规的强制性规定（如规定了低于法定标准的退还金额等），那么该协议可能被视为无效。无效协议自始没有法律约束力，员工无需按照无效协议履行退还义务。
- 建议：在这种情况下，员工应首先收集相关证据（如胁迫、欺诈的证据或协议违法性的证据），然后咨询专业律师进行评估。如果律师认为协议存在瑕疵或违法情形，员工可以考虑通过法律途径维护自身权益，如提起诉讼或申请仲裁等。
三、其他注意事项
- 核对工资发放记录：在处理此类纠纷时，员工应首先核对自己的工资发放记录，确认是否存在多发工资的情况。如果确实存在多发工资，且员工同意退还，那么应尽快与公司协商退还事宜。
- 保留相关证据：无论员工是否同意退还多发工资，都应保留好相关证据（如工资条、银行转账记录、协议文本等），以备不时之需。
- 及时咨询专业律师：如果员工对协议内容或退还义务存在疑问，或认为协议存在瑕疵或违法情形，应及时咨询专业律师进行评估和指导。
总之，针对公司要求退还多发工资且员工已签署协议的情况，员工应首先核对协议内容和工资发放记录，确认是否存在多发工资的情况以及协议是否合法有效。如果协议合法有效且内容明确，员工应按照协议约定履行退还义务；如果协议存在瑕疵或违法情形，员工可以考虑通过法律途径维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。