超载罚款和缺配员罚款的严重性并不能直接比较，因为它们涉及不同的违法行为，且罚款数额和后果可能因具体情况和地区政策而异。下面我将分别从超载和缺配员两个方面进行分析：

一. 超载罚款

1. 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条第二款规定，货运机动车超过核定载质量的，处200元以上500元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处500元以上2000元以下罚款。
2. 罚款数额与后果：超载的罚款数额根据超载的严重程度而定，最高可达2000元。此外，超载还可能导致车辆性能下降，增加交通事故的风险，对道路安全构成严重威胁。因此，超载不仅面临经济处罚，还可能对驾驶人的安全记录和车辆运营产生影响。

二. 缺配员罚款

1. 法律依据：对于缺配员的罚款，具体规定可能因地区和政策而异。一般来说，如果车辆未按照规定配备足够的驾驶员或乘务员，可能会面临相应的罚款和其他处罚措施。
2. 罚款数额与后果：缺配员的罚款数额和后果通常根据缺配的程度和地区政策来确定。虽然具体数额可能不如超载罚款高，但缺配员同样会影响车辆的正常运营和乘客的安全，因此也可能面临严重的法律后果。

总结：超载和缺配员都是违反交通法规的行为，它们各自面临的罚款数额和后果因具体情况和地区政策而异。因此，无法直接判断哪种罚款更严重。我的观点是，无论超载还是缺配员，都应该严格遵守交通法规，确保车辆的安全运营和乘客的生命财产安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。