结论：总经理在处罚单上更改并加重处罚的行为，其合规合法性需视具体情况而定，但通常情况下，这种做法可能存在合规风险。

一、从公司规章制度的角度分析

1. 规章制度的内容与程序：

   • 公司规章制度应当明确规定员工犯错时的处罚种类、幅度以及决定处罚的主体和程序。
   • 如果规章制度中明确规定了处罚的决定权在部门层面，且未赋予总经理直接更改处罚单的权力，那么总经理擅自更改并加重处罚可能违反了公司规章制度。

2. 规章制度的合法性：

   • 公司规章制度必须符合法律法规的规定，不得侵犯员工的合法权益。
   • 如果规章制度本身存在违法内容，或者总经理的行为超出了规章制度的授权范围，那么这种行为可能被视为违法。

二、从劳动合同与劳动法的角度分析

1. 劳动合同的约定：

   • 劳动合同是员工与公司之间约定权利义务的重要文件。
   • 如果劳动合同中明确规定了处罚的种类和幅度，且未赋予公司单方面更改处罚的权力，那么总经理擅自更改处罚单可能违反了劳动合同的约定。

2. 劳动法的保护：

   • 劳动法规定，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。
   • 总经理擅自更改处罚单并加重处罚，可能侵犯了员工的合法权益，如获得公正评价的权利、不受无故处罚的权利等。

三、从公司治理与内部管理的角度分析

1. 公司治理结构：

   • 公司治理结构应当明确各层级的管理权限和职责。
   • 如果总经理的行为超出了其管理权限，或者违反了公司治理结构的规定，那么这种行为可能被视为不当。

2. 内部管理流程：

   • 公司内部管理流程应当规范、透明，确保决策的公正性和合理性。
   • 总经理擅自更改处罚单并加重处罚，可能破坏了公司内部管理流程的规范性和透明性。

四、建议与措施

1. 审查规章制度：

   • 公司应审查其规章制度，确保其中关于处罚的规定合法、合规，并明确处罚的决定权和程序。

2. 加强沟通与协商：

   • 在处理员工犯错问题时，公司应加强与员工的沟通与协商，确保处罚的公正性和合理性。

3. 完善内部管理流程：

   • 公司应完善内部管理流程，确保决策的规范性和透明性，避免类似情况的发生。

4. 寻求法律帮助：

   • 如果公司或员工对处罚存在争议，可以寻求法律帮助，通过法律途径解决争议。

具体案例与法律解释：

• 假设某公司规章制度中明确规定，员工犯错时，由部门负责人决定处罚种类和幅度，并报公司备案。若某员工犯错后，部门出具了处罚单，但总经理擅自更改并加重了处罚。在此情况下，总经理的行为可能违反了公司规章制度，因为规章制度未赋予其直接更改处罚单的权力。

• 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。总经理擅自更改处罚单并加重处罚，可能侵犯了员工的合法权益，员工有权通过法律途径维护自己的权益。

后续行动建议：

• 如果您是公司方，建议审查并完善规章制度，明确处罚的决定权和程序，避免类似情况的发生。
• 如果您是员工方，且认为总经理的行为侵犯了您的合法权益，可以与公司进行沟通协商，或寻求法律帮助维护自己的权益。

有问题可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。