人防工程被占用是否违法，需结合具体情况判断，但通常情况下，未经许可占用人防工程属于违法行为。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法律依据与性质认定

• 《中华人民共和国人民防空法》明确规定，人民防空工程（包括为保障战时人员与物资掩蔽、人民防空指挥、医疗救护等而单独修建的地下防护建筑，以及结合地面建筑修建的战时可用于防空的地下室）属于国防设施，受法律保护。
• 违法情形：若占用行为未经人防主管部门批准，或擅自改变人防工程用途（如将防空地下室改为商业用途、仓库等），均构成违法。

2. 具体违法情形与后果

• 擅自占用：未取得使用许可，强行进入或使用人防工程，可能面临行政处罚，包括责令限期改正、罚款等。
• 改变用途：若将人防工程用于非战时用途（如居住、经营），且未办理变更手续，除行政处罚外，还可能承担民事赔偿责任（如因占用导致工程损坏需修复）。
• 破坏结构：若占用过程中破坏人防工程结构或防护功能，可能涉嫌犯罪，依法追究刑事责任。

3. 合法占用的例外情形

• 战时使用：根据《人民防空法》，战时人防工程应优先用于防空需要，此时占用属合法行为。
• 平时利用：经人防主管部门批准，可临时用于社会公益或商业活动（如地下停车场、商场），但需签订使用协议，明确权利义务。

4. 法律建议

• 若您是占用方：立即停止违法行为，联系当地人防主管部门补办手续或腾退工程。
• 若您是权益受损方（如工程所有者、管理者）：可向人防部门举报，或通过民事诉讼要求停止侵害、赔偿损失。
• 预防措施：使用人防工程前，务必确认是否取得合法许可，并严格按批准用途使用。

5. 典型案例参考

• 某公司未经批准将人防地下室改为员工宿舍，被处以罚款并责令恢复原状。
• 某小区业主擅自占用防空地下室堆放杂物，经人防部门责令整改后未执行，最终被强制执行并承担执行费用。

总结：人防工程的占用合法性取决于是否取得许可及是否改变用途。建议涉及人防工程时，先咨询当地人防主管部门，确保行为合法。如有具体纠纷，可进一步向我咨询，我会结合细节为您提供更精准的法律意见。