若案件已立案，您怀疑对方存在不正当关系影响案件公正性，可采取以下法律措施维护自身权益：

一、法律程序内的救济途径

1. 申请回避
   根据《刑事诉讼法》第二十九条，若您发现审判人员、检察人员、侦查人员存在以下情形，有权申请其回避：

   • 是本案当事人或近亲属；
     
   • 本人或近亲属与本案有利害关系；
     
   • 担任过本案证人、鉴定人、辩护人、诉讼代理人；
     
   • 与本案当事人有其他关系可能影响公正处理。
     操作建议：立即向办案机关提交书面回避申请，附具体事实依据（如对方与办案人员存在利益输送的证据）。

2. 提出管辖权异议
   若怀疑案件存在地方保护或人为干预，可依据《刑事诉讼法》第二十条，对管辖权提出异议。例如，认为案件应由上级法院管辖或异地审理更公正。
   操作建议：在答辩期内提交管辖权异议申请，说明当前管辖可能影响公正审判的具体理由。

3. 申请监督
   根据《人民检察院刑事诉讼规则》第五百六十七条，若发现侦查、审判活动违法，可向同级或上级检察院申请立案监督、侦查活动监督或审判活动监督。
   操作建议：提交书面监督申请，附违法线索（如对方干预办案的录音、书面证据等）。

二、证据收集与固定

1. 留存对方干预的证据

   • 书面材料：如对方与办案人员往来的函件、转账记录；
     
   • 录音录像：若抓拍到对方与办案人员不当接触；
     
   • 证人证言：知情人员对干预行为的陈述。
     注意：证据需合法取得，避免侵犯他人隐私或违反法定程序。

2. 申请调取监控或通信记录
   若怀疑对方通过电话、短信干预办案，可申请法院调取相关通信记录。
   操作建议：在举证期限内提交调取证据申请，明确需调取的时间范围、对象及证明目的。

三、外部监督与投诉

1. 向纪检监察机关举报
   若发现办案人员存在受贿、徇私枉法等行为，可向当地纪委监委实名举报。
   操作建议：提交书面举报材料，附初步证据（如银行流水、行贿记录等），并要求书面回复处理结果。

2. 通过媒体或公开渠道施压
   在合法范围内，可通过正规媒体或公开平台反映问题（需确保内容真实），促使办案机关重视程序公正。
   注意：避免捏造事实或侵犯他人名誉权，否则可能承担法律责任。

四、后续程序保障

1. 二审或再审救济
   若一审判决不公，可依法上诉；若发现新证据或原判决存在法定错误，可申请再审。
   操作建议：在上诉期或再审申请期内提交书面材料，重点论证原审程序违法或实体错误。

2. 刑事控告干预行为
   若对方通过贿赂、威胁等手段干预司法，可向公安机关报案，追究其刑事责任（如行贿罪、妨碍作证罪）。
   操作建议：提交报案材料，附干预行为的证据链，要求公安机关立案侦查。

五、风险提示与策略建议

1. 避免情绪化行动
   怀疑对方“有关系”时，需保持冷静，通过法律程序解决，避免与对方发生冲突或散布不实言论。

2. 及时咨询专业律师
   刑事案件程序复杂，建议委托律师全程参与，制定针对性策略（如申请异地管辖、调取关键证据等）。

3. 关注程序节点
   严格把握回避申请、管辖权异议、举证期限等关键时间点，逾期可能丧失救济权利。

若您已掌握对方干预的具体证据，建议立即整理并提交至办案机关或监督部门；若证据不足，可通过合法途径进一步调查取证。 如有具体线索或材料，可向我详细说明，我将协助制定进一步方案。