车辆在限时行驶路段违规行驶的处罚措施，确实会因地区及具体情况的不同而有所差异。以下是对这一问题的详细解答：
一、常见处罚方式
罚款：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，通常会被处以二十元以上二百元以下的罚款。具体罚款数额会根据地区差异而有所不同，例如，某些城市可能初次违反限行规定就处以一定金额的罚款，而部分地区则可能罚款更高。
扣分：
- 对于限行时段违规行驶的行为，部分地方还会采取扣分的处罚措施。扣分的一般范围在1分至3分不等，具体数值同样依地区规定而异。
既罚款又扣分：
- 在部分地区，对于限行时间段行驶的违法行为，会采取更为严格的处罚措施，即同时罚款与扣分。
二、按违法性质定性及处罚
“机动车违反禁令标志指示”：
- 如果受限机动车在设置了禁止通行标志的限行区域道路行驶，将按此定性。通常会处以罚款并记分，罚款金额在二十元以上二百元以下，记分一般为1-3分。
“机动车未按规定在限制、禁止的区域或路段通行”：
- 对于没有设置禁止通行标志的限行区域，如果机动车违规行驶，将按此定性。依据相关法律规定，这种情况通常会处以二十元以上二百元以下罚款，但不记分。
三、特定地区的限行处罚规定示例
- 成都：驾驶证记1分、罚款100元。
- 深圳：限行时间内违反限行规定的车辆，将处以300元罚款并记1分。非深圳核发机动车号牌载客汽车前两次违反禁行规定不予处罚，自第三次起进行罚款处罚。
- 北京：违反限行规定处100元罚款。本地车在一个工作日内多次违规只罚一次；外地车每3小时被抓拍一次，每次罚款100元并记1分。
- 上海：违规驶入限行区域将罚款200元。当天多次被电子眼抓拍只算一次违规；若当天先被交警查获再被电子眼抓拍，也不再重复处罚。
- 广州：处200元罚款并记1分。非广州市籍中小客车在管控区域最长连续行驶4天，之后需间隔4天以上方可再次驶入。
四、其他注意事项
外地车与本地车差异：部分城市对本地车和外地车的处罚标准可能不同，也可能对外地车有一定的“容错期”，如初次违反不处罚，仅给予警告等。
特殊时期限行：在重污染天气等特殊时期，实施的临时限行措施及其处罚规定也可能有所变化。
连续处罚：如果机动车在限行日多次开车进入限行区域，可能会面临连续处罚的风险。
五、建议
为避免不必要的处罚，车主应在出行前通过官方渠道（如交通管理部门网站、手机APP等）查询并了解当地的限行政策和规定，合理规划路线和时间，确保不违反限行规定。同时，关注交通管理部门发布的最新信息，以获取最准确的处罚信息和限行政策调整。
综上所述，车辆在限时行驶路段违规行驶的处罚措施具有显著的地域性和差异性。驾驶人在行驶前应仔细了解当地的限行规定，并严格遵守，以确保自身合法权益不受损害。