在电动摩托车承担主要责任、小轿车承担次要责任的交通事故中，赔偿应首先通过交强险进行赔付，超出部分按责任比例（通常电动摩托车70%，小轿车30%）分担，并可由商业险进一步赔付。协商不成时，可通过法律途径解决。以下是详细的分析和解答：
一、责任划分与赔偿原则
- 责任划分：根据交警部门出具的事故认定书，确定电动摩托车承担主要责任，小轿车承担次要责任。这意味着在赔偿时，双方需按照各自的责任比例分担损失。
- 赔偿原则：一般遵循“先交强险后商业险”的原则。先由小轿车的交强险在限额内承担赔偿责任，不足部分再由商业险或双方按责任比例分担。
二、具体赔偿流程
报案与定损：
- 事故发生后，双方应及时向各自的保险公司报案，并保护好现场，等待交警到场处理。
- 保险公司会派查勘员到现场进行勘查，并根据车辆受损情况出具定损报告。这是后续理赔的重要依据。
提交理赔材料：
- 双方需准备并提交相关理赔材料，如事故认定书、驾驶证、行驶证、保险单、维修发票等。这些材料是保险公司审核理赔申请的关键。
保险公司审核与赔付：
- 审核材料：保险公司会对提交的理赔材料进行审核，确认事故的真实性和责任的划分。
- 计算赔偿金额：根据定损报告和责任比例，计算应赔付的金额。例如，如果总损失为10万元，电动摩托车主责占70%，小轿车次责占30%，则小轿车方（含其保险公司）应承担3万元的赔偿责任（不考虑免赔率等因素）。
- 支付赔款：审核通过后，保险公司会将赔款支付给被保险人或指定的收款人。对于财产损失，一般直接支付给受损方；对于人身伤害，可能涉及预付医疗费用和后期一次性赔偿等。
三、赔偿内容
- 人身损害赔偿：包括医疗费、误工费、护理费、营养费、残疾赔偿金（如构成伤残）、精神损害抚慰金等治疗和康复支出的合理费用。
- 财产损失赔偿：包括车辆修理费、财物损失等。
四、特殊情况处理
- 互碰自赔：若双方均投保了交强险，且损失均在2000元以内，可采用“互碰自赔”方式快速处理。即双方各自向自己的保险公司索赔，无需互相追究责任。但需注意，这种方式不适用于有人身伤亡或超出交强险限额的情况。
- 协商调解：在理赔过程中，双方可就赔偿金额、支付方式等进行协商调解。若达成一致意见，可签订赔偿协议并履行。
- 诉讼解决：若协商不成或存在争议，可通过法律途径解决。向法院提起诉讼，由法院根据事实和法律规定作出判决。
五、责任比例与赔偿计算示例
- 责任比例：一般情况下，电动摩托车承担70%责任，小轿车承担30%责任，但具体比例可能根据事故实际情况由交警认定或双方协商确定。
- 计算方式：对于超出交强险赔偿限额的部分，按照上述责任比例分担。例如，若电动摩托车总损失20万元，交强险已赔10万元，剩余10万元由小轿车方承担30%（即3万元），电动摩托车方自行承担70%（即7万元）。
六、商业险赔付
- 若小轿车投保了商业第三者责任险，其承担的超出交强险部分的赔偿责任可由商业险在保险限额内赔付。
在处理此类交通事故赔偿问题时，建议双方保持沟通，严格按照法律规定和保险合同约定操作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。