针对您提出的“夫妻双方都是军人，男方有婚外情怎么处理”的问题，这是一个涉及法律、道德和军队纪律的复杂情况。以下是我为您提供的详细分析和应对建议：
一、法律层面分析
破坏军婚罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百五十九条，如果第三方明知是现役军人的配偶而与之同居或结婚，将受到三年以下有期徒刑或者拘役的处罚。但在此案例中，由于夫妻双方都是军人，这一条款主要适用于第三方介入的情况。不过，若男方的婚外情行为达到了与第三方同居或结婚的程度，且该第三方非军人，则可能触犯此罪。
- 重要的是要明确，“同居”指的是持续、稳定地共同生活，而非偶尔的出轨行为。单纯的婚外情，未达到同居或结婚程度，一般不构成破坏军婚罪。
离婚相关法律规定：
- 《中华人民共和国民法典》第一千零八十一条规定，现役军人的配偶要求离婚，需征得军人同意，除非军人一方有重大过错。在此案例中，若男方有婚外情并构成重婚或与他人同居等重大过错，女方（作为现役军人）可提出离婚，并在财产分割、子女抚养上争取有利条件。
- 离婚时，共同财产由双方协议处理；协议不成时，法院将根据照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。作为无过错方的女方，可要求适当多分财产。
- 若男方的婚外情行为导致离婚，且符合重婚、与他人同居等情形，女方可在离婚时要求损害赔偿。
二、军队内部处理
部队调解：
- 女方可以向所在部队反映情况，部队相关部门可能会出面调解，尽力维护军人婚姻家庭的稳定。这包括对男方进行教育和劝诫，促使其认识到错误并改正。
纪律处分：
- 由于夫妻双方都是军人，男方的婚外情行为不仅违反了社会公德，还可能违反军队纪律。军队将根据纪律条例给予相应处分，处分种类和程度将依具体情节而定，可能包括警告、严重警告、记过、记大过、降职（级）、撤职、开除军籍等。
三、应对建议
收集证据：
- 在采取任何行动前，女方应收集充分证据以证明男方的婚外情行为，如通信记录、照片、视频等。这些证据将在后续的法律程序或军队内部处理中起到关键作用。
与男方沟通：
- 尽管困难，但与男方坦诚沟通是必要的。女方可以表达自己的感受和担忧，尝试了解男方的立场和想法。有时，通过沟通可以解决问题或增进理解，但也可能需要做好无法达成一致的准备。
寻求法律援助：
- 女方应咨询专业律师，获取针对个人情况的法律建议。律师可以帮助女方制定合适的策略，包括起诉离婚、要求赔偿等。
寻求心理支持：
- 处理婚外情可能对女方的情感造成冲击。因此，寻求心理咨询师或心理医生的帮助是很重要的。他们可以提供情绪支持、应对策略和实用建议，帮助女方度过难关。
尊重婚姻和家庭：
- 无论最终处理结果如何，女方都应深刻反思婚姻关系中的问题，并努力修复因男方不当行为而受损的关系（如果可能的话）。同时，也要尊重自己的感受和需求，做出对自己最有利的决定。
综上所述，夫妻双方都是军人且男方有婚外情的情况下，应从法律、军队纪律和实际操作等多个方面综合考虑处理方式。确保行动合法、道德，并有效保护自身权益是至关重要的。