结论：农村集体承包合同期内可以签订补充协议，但需满足法定条件并履行相应程序。以下从法律适用、签订条件、程序要求及风险提示四个角度展开分析：

1. 法律适用性

根据《民法典》第五百四十三条及《农村土地承包法》第三十五条，合同双方在合同履行期间可协商变更合同内容，包括签订补充协议。但需注意：

• 变更范围：补充协议不得违反法律强制性规定（如土地用途管制、承包期限限制等）；
• 主体资格：发包方（村集体）与承包方（农户/经营主体）需具有完全民事行为能力；
• 意思表示真实：协议内容需双方自愿协商，不存在欺诈、胁迫等情形。

2. 签订条件

补充协议的生效需满足以下实质要件：

• 不损害集体利益：若涉及土地流转、用途变更等，需经村民会议或村民代表会议三分之二以上成员同意（《村民委员会组织法》第二十四条）；
• 不突破原合同框架：补充内容应与原合同目的、承包期限等核心条款一致，例如原合同约定种植粮食作物，补充协议不得擅自改为非农建设；
• 书面形式要求：根据《民法典》第四百七十条，补充协议应采用书面形式，明确变更事项、生效时间及违约责任。

3. 程序要求

实践中需履行以下程序以确保合法性：

• 民主议定程序：涉及集体资产处置或重大利益调整时，需按《农村土地承包法》第十九条召开村民会议，形成书面决议；
• 备案或审批：部分地区要求补充协议报乡镇政府备案，涉及土地用途变更的需经自然资源部门审批；
• 公示公告：协议签订后应在村务公开栏公示，接受集体成员监督。

4. 风险提示

• 无效情形：若补充协议存在“以租代征”改变土地农业用途、未经民主议定程序擅自处分集体资产等情形，可能被认定为无效；
• 违约责任：未履行法定程序导致协议无效的，双方可能承担缔约过失责任，需赔偿对方实际损失；
• 行政处罚：擅自变更土地用途可能面临土地管理部门责令改正、罚款等行政处罚。

建议：签订补充协议前，建议双方核对原合同条款，明确变更内容是否符合法律及政策要求，必要时委托律师起草协议并协助履行民主议定程序。如有具体条款设计或程序疑问，可直接向我咨询。