违法所得退款后，罚款的计算通常仍以原违法所得数额为基础，但需结合具体法律规定和案件情节综合判定。以下是详细分析：

1. 罚款基数通常为违法所得数额
   根据《行政处罚法》第二十八条，行政机关实施行政处罚时，应当责令当事人改正或限期改正违法行为。当事人有违法所得的，除依法应当退赔的外，应当予以没收。罚款的数额通常与违法所得直接相关，例如《反不正当竞争法》规定，经营者违法所得难以计算的，罚款幅度可能按营业额比例确定；但若能明确计算违法所得，罚款一般以该数额为基准。

2. 退款不影响违法所得的认定，但可能影响罚款幅度
   退款行为属于事后补救措施，不改变违法所得已产生的事实。例如，若商家通过虚假宣传获利10万元，即使后续全额退款，其违法所得仍为10万元，罚款可能以此为基数。但根据《行政处罚法》第三十二条，当事人主动消除或减轻违法行为危害后果的，行政机关应依法从轻或减轻处罚。因此，退款可能成为从轻、减轻罚款的情节，但具体幅度需由行政机关结合案件整体情况裁量。

3. 特殊情形下的计算规则

   • 违法所得难以计算时：若违法所得无法准确核算（如成本与收益混同），行政机关可能按《价格违法行为行政处罚规定》等法规，以“违法所得无法确定时按无违法所得论处”或“按营业额比例罚款”。
     
   • 刑事转行政处理时：若案件涉及刑事追诉后退回行政程序，违法所得的认定仍以刑事阶段查明的数额为准，罚款计算逻辑不变。
     
   • 连续或继续状态违法行为：如长期非法经营，违法所得按整个违法期间的总收入减去合法支出计算，退款不影响总额认定。

建议：若您面临此类问题，需重点保留违法所得的计算依据（如合同、账目、转账记录等），并主动向行政机关提交退款证明，以争取从轻处理。具体案件中，罚款数额还需结合地方性法规、行业规定及自由裁量权标准综合判定。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律适用问题。