结论：老板因自身原因未核对货物数量而扣员工工资，这一行为通常是不合法的。

分析：

1. 工资支付原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，与货物数量的核对无直接关联，除非劳动合同或公司规章制度中有明确约定，且该约定不违反法律法规。

2. 扣工资的合法性：

   • 老板因自身原因（如未核对货物数量）而扣员工工资，这并不构成合法的扣工资理由。除非能够证明员工的过错或疏忽直接导致了货物数量的错误，并且这种过错或疏忽在劳动合同或公司规章制度中被明确列为可以扣工资的情形。
   • 即便存在相关约定，扣工资的金额也应当合理，且不得违反法律法规中关于最低工资标准、工资支付周期等规定。

3. 劳动者的权益：

   • 劳动者有权要求用人单位按照劳动合同约定支付工资。如果老板无故扣工资，劳动者可以通过与老板协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。

4. 可能的法律后果：

   • 如果老板的行为被认定为违法扣工资，除了需要补发工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
   • 在极端情况下，如果老板的行为构成恶意拖欠工资，还可能触犯《中华人民共和国刑法》中的相关规定，面临更严重的法律后果。

建议：

• 与老板沟通：首先，你可以尝试与老板进行沟通，了解扣工资的具体原因，并表达自己的不满和诉求。
• 收集证据：如果沟通无果，你可以收集相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以证明自己的工资被无故扣除。
• 寻求法律援助：你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，也可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律援助和指导。

总结：老板因自身原因未核对货物数量而扣员工工资，这一行为通常是不合法的。劳动者有权要求用人单位按照劳动合同约定支付工资，并可以通过合法途径来维护自己的权益。如果你遇到类似问题，可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律帮助。