被征收房屋“两间并一户”是否合法，需结合产权登记情况及拆迁政策综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 若两间房屋具有独立产权，合并为一户补偿可能不合法

• 法律依据：根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二条，征收补偿应针对“被征收房屋所有权人”。若两间房屋分别持有独立房产证或土地使用证，则属于不同产权主体，拆迁时应分别补偿。
• 法律后果：若相关部门未调查产权，直接将两间独立产权房屋合并为一户补偿，可能构成程序违法。被征收人可通过行政复议或诉讼主张权利，要求按独立产权分别补偿。

2. 若两间房屋为同一产权，合并为一户补偿通常合法

• 实践操作：实践中，同一产权人名下的多间房屋可能因历史原因（如分户登记）被登记为不同户，但实际产权归属同一主体。此时，拆迁政策按一户补偿符合“避免重复补偿”原则。
• 例外情形：若合并补偿导致补偿标准显著低于市场价值（如未补偿装饰装修、搬迁费等），被征收人可要求补充补偿或通过法律途径维权。

3. 程序合法性是关键

• 产权调查义务：根据《行政诉讼法》第三十四条，行政机关对作出的行政行为负有举证责任。若相关部门未履行产权调查程序，直接认定“两间并一户”，可能因证据不足被撤销补偿决定。
• 典型案例：某地拆迁中，行政机关未核实房产证，将两户独立产权房屋合并补偿，法院判决撤销补偿决定，责令重新调查。

法律建议

1. 核查产权证明：被征收人应首先确认两间房屋是否持有独立房产证或土地使用证。若存在独立产权，需在拆迁前向征收部门提出异议。
2. 要求公开补偿依据：根据《政府信息公开条例》，被征收人有权要求征收部门公开补偿方案、产权认定标准等文件，核查是否存在程序违法。
3. 及时维权：若对补偿决定不服，应在收到决定之日起60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼，避免超过时效。

如有具体产权情况或补偿方案，可进一步向我提供细节，我将结合地方政策为您分析合法性及维权策略。