收费员利用职务之便偷逃通行费400元以上，属于职务侵占或贪污的违法行为，具体处理方式需根据其身份性质和情节严重程度判定，可能面临行政处罚、刑事追责及单位内部处分。以下是具体分析：

1. 法律定性：职务侵占或贪污

• 若收费员为非国家工作人员（如企业员工）：
  其行为可能构成《刑法》第271条规定的职务侵占罪，但需注意，职务侵占罪的立案标准通常为“数额较大”（一般6万元以上），400元未达刑事立案标准。不过，若单位规章制度明确将此类行为列为严重违纪，可能触发内部处分或劳动法相关责任。
• 若收费员为国家工作人员（如事业单位或国企员工）：
  其行为可能构成《刑法》第382条规定的贪污罪，贪污罪的立案标准为“数额较大”（一般3万元以上），400元同样未达刑事标准。但根据《刑法》第383条，贪污数额不满3万元但具有其他较重情节（如多次贪污、贪污救灾款物等），仍可能被追究刑事责任。

2. 行政处罚与单位内部处理

• 行政处罚：
  即使未达刑事立案标准，收费员的行为仍可能违反《治安管理处罚法》第49条（盗窃、诈骗、哄抢、抢夺、敲诈勒索或故意损毁公私财物），可处5-15日拘留及罚款。但偷逃通行费更倾向认定为“职务便利下的不当得利”，可能更适用单位内部规定或行业规范。
• 单位内部处分：
  单位可依据《劳动合同法》第39条（严重违反用人单位规章制度）解除劳动合同，或根据内部《员工手册》给予警告、记过、降薪等处分。

3. 情节加重的认定

• 若收费员存在多次偷逃、串通他人作案、造成重大损失或社会影响等情节，即使单次金额不足，也可能被认定为“情节严重”，从而升级处罚。例如：
  • 累计偷逃金额达刑事标准；
  • 伪造票据、篡改数据等手段恶劣；
  • 拒不退还违法所得。

4. 实务建议

• 对单位：应完善内部监控机制（如录像、数据核对），明确违纪处理流程，及时固定证据（如监控录像、通行记录、证人证言）。
• 对收费员：若已实施该行为，应立即停止并退还违法所得，主动向单位坦白以争取从轻处理；若面临调查，需配合但避免自证其罪（如未被询问时勿主动承认）。

提示：具体处理需结合行为人身份、行为频率、金额累计等细节。如有进一步证据或疑问，可直接向我提供具体情形，我将结合案例与法条为您细化分析。