作为公司的法人代表，若您希望注销一家存在案件的公司，这确实是一个涉及多个法律环节和行政程序的复杂过程。以下是我为您整理的详细注销流程及注意事项，希望能为您提供清晰的指导。
一、决策与内部审批
首先，您需要确保公司内部对注销事宜达成一致意见。这通常意味着要召开股东会或董事会（如果公司设有此类治理结构），并就注销事宜进行表决，形成书面决议。根据《公司法》的相关规定，公司解散需由股东会或董事会作出决议，这是注销流程的第一步，也是至关重要的一步。
二、成立清算组
在解散事由出现之日起十五日内，公司应成立清算组，开始清算工作。清算组的组成人员根据公司的类型有所不同：有限责任公司的清算组由股东组成，而股份有限公司的清算组则由董事或股东大会确定的人员组成。清算组的职责包括清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知和公告债权人、处理未了结业务、清缴税款及清算过程中产生的税款、清理债权债务以及分配剩余财产等。
三、债权申报与清偿
清算组成立后，需要在十日内通知债权人，并在六十日内在报纸上公告，接受债权人的债权申报。在清偿债务时，需要按照法定的顺序进行：首先是清算费用，其次是职工工资、社会保险费用和法定补偿金，再次是所欠税款，最后是公司其他债务。在清偿所有债务后，剩余财产将按照股东的出资比例（有限责任公司）或股东持有的股份比例（股份有限公司）进行分配。
四、税务注销
在清算工作完成后，您需要向主管税务机关提交相关材料，包括营业执照副本、公章、财务报表、发票领购簿及未使用完的发票等，申请注销税务登记。税务机关将对公司的纳税情况进行检查，如有欠税、漏税等问题，您需要补缴税款和滞纳金。完成后，税务机关将出具《清税证明》。
五、工商注销
取得税务注销证明后，您可以准备相关材料，包括注销登记申请书、指定代表或委托代理人的证明及身份证件复印件、公司决议或决定文件、清算报告确认文件、税务注销证明等，向公司登记机关申请注销公司登记。登记机关将对申请材料进行审核，如材料齐全、符合法定形式，将予以受理并核准注销登记，收缴公司营业执照。
六、其他相关手续
除了税务和工商注销外，您还需要办理银行账户注销、社保和公积金账户注销以及印章注销等手续。这些手续的具体办理流程和所需材料可能因地区而异，建议您咨询当地相关部门或专业机构以获取准确信息。
注意事项
地区差异：不同地区的具体注销流程和要求可能有所不同，建议您在注销前详细咨询当地工商行政管理部门、税务机关等相关部门。
法律风险：由于注销过程中涉及的法律文件和程序较为复杂，且您提到公司存在案件，这可能会增加注销的难度和风险。因此，我建议您由专业律师协助处理以确保合规性，避免因程序不当引发法律风险。
特殊情况处理：如果公司被吊销营业执照、涉及诉讼等特殊情况，注销程序可能会更加复杂。在这种情况下，您需要根据具体情况进行处理，并可能需要寻求专业法律帮助。
总之，注销一家存在案件的公司是一个严谨且复杂的过程。作为法人代表，您需要严格按照法律法规进行操作，并确保每个环节的准确性和完整性。如遇问题或困难，我建议您及时咨询专业律师或会计师以获取专业指导和帮助。