针对您提出的“店铺非法经营怎么处罚”的问题，我将结合相关法律法规和司法实践，为您详细解答。
首先，非法经营罪是经济犯罪领域较为常见的罪名之一，它指的是违反国家规定，进行非法经营活动，扰乱市场秩序，且情节严重的行为。对于店铺非法经营的具体处罚，主要依据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定。
根据该法条，违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，将面临以下处罚：
具体到店铺非法经营的情况，如果店铺未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品（如烟草、药品等）或其他限制买卖的物品，或者买卖进出口许可证、进出口原产地证明等法律、行政法规规定的经营许可证或批准文件，以及未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务或非法从事资金支付结算业务的，都可能构成非法经营罪。
在判断是否构成非法经营罪时，关键在于是否达到“情节严重”的标准。这通常包括非法经营的数额、违法所得数额、经营时间长短、造成的社会影响等因素。例如，如果店铺非法经营的数额巨大，或者违法所得数额较多，且经营时间较长，形成了稳定的销售网络和较大的市场影响，那么就可能被认定为情节严重。
此外，如果店铺在案发后能够积极配合调查，如实供述自己的行为，并表现出悔罪态度，那么在量刑时可能会得到一定的从轻处理。
以具体案例为例，如果某店铺在未取得烟草专卖零售许可证的情况下销售香烟，且被查获的香烟价值较高，那么该店铺的经营者就可能因涉嫌非法经营罪而被立案侦查、审查起诉，并最终进入法院审判阶段。如果法院认定其行为构成非法经营罪且情节严重，那么就可能面临上述的刑事处罚。
综上所述，店铺非法经营的处罚取决于其非法经营行为的性质、情节以及造成的后果。因此，建议店铺在经营过程中务必遵守相关法律法规，确保合法经营。如果遇到相关法律问题或疑虑，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见。