针对您提出的“承包户中的整户消亡和实际中的整户消亡不一样怎么办”这一问题，我们需要从法律解析、实务操作以及风险防范等多个层面进行详细阐述。
一、核心概念界定与差异分析
首先，我们需要明确“承包方消亡”的法律定义。在农村土地承包关系中，承包方消亡指的是作为合同主体的农户或经济组织因法定事由（如自然人死亡、法人终止、非法人组织解散等）而丧失民事主体资格。这里提到的“整户消亡”，在法律上通常指的是家庭承包中整户成员的灭失。
然而，您提到的“实际中的整户消亡”可能与法律定义存在差异。这种差异可能源于对“整户”的理解不同，或者在实际操作中，由于户籍变动、人口流动等原因，导致承包户的实际成员与法律登记的成员不一致。这种情况下，如何认定“整户消亡”就成为了一个关键问题。
二、法律后果与实务处理
承包合同效力：
- 根据《民法典》和《农村土地承包法》的相关规定，民事法律行为效力随主体消灭而终止。但土地承包经营权具有特殊性，承包期内不得随意收回承包地。
- 对于家庭承包，整户消亡时，发包方有权收回土地，但需遵循法定程序。
实务操作指南：
- 认定程序：首先，需要核查户籍档案以确认整户消亡的事实。如果实际成员与法律登记成员不一致，应进一步调查核实，确保认定结果的准确性。其次，发布公示公告，告知相关权利人并征求意见。最后，制作《承包方消亡确认书》并存档。
- 土地处置流程：根据承包类型的不同，土地处置方式也有所差异。对于家庭承包，整户消亡后，土地应收回并重新发包；对于林地承包和四荒地承包，则可能允许继承人继续承包或享有优先续包权。
三、争议解决与风险防范
争议解决机制：
- 如果在实际操作中遇到争议，如对整户消亡的认定有异议，可以通过行政救济（如向乡镇政府申请确权）或司法途径（如提起民事诉讼）来解决。
风险防范建议：
- 完善登记制度：建立承包方动态管理台账，定期更新人口信息，确保法律登记与实际情况的一致性。
- 规范合同条款：在承包合同中明确消亡后的处置条款，减少争议发生的可能性。
- 强化基层治理：发挥村民会议或代表会议的民主议决作用，确保土地处置的公正性和合理性。
- 政策衔接保障：与农业补贴、土地流转等政策形成联动机制，保障承包方的合法权益。
四、特殊情况与延伸思考
- 对于五保户等无继承人的承包方，是否应保留基本生活保障用地？这需要根据当地政策和实际情况进行综合考虑。
- 随着新型经营主体（如家庭农场、合作社）的兴起，其消亡时的土地退出机制也需要进一步优化和完善。
- 在城乡融合的背景下，进城落户农户的土地权益如何与集体所有权平衡？这也是一个值得深入探讨的问题。
综上所述，针对您提出的问题，我们需要从法律定义、实务操作、争议解决以及风险防范等多个层面进行综合考虑和处理。在实际操作中，应确保法律登记与实际情况的一致性，并遵循法定程序进行土地处置。同时，也需要关注特殊情况和延伸问题，为农村土地承包关系的稳定和可持续发展提供有力保障。