他项权证在以下情况下法院可能会判无效：

1. 抵押登记行为存在重大瑕疵且非当事人真实意思表示：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，设立抵押权应基于当事人真实的意思表示，并采用书面形式订立抵押合同。若抵押登记过程中存在伪造授权委托书、身份证明等文件，导致抵押登记并非当事人真实意思表示，法院可能会认定他项权证无效。例如，在某案例中，银行与借款人签订借款合同，并由第三人提供房产抵押担保。然而，该第三人并未亲自办理抵押登记，而是由借款人法定代表人伪造其授权委托书和身份证明办理。在此情况下，法院认为抵押登记存在重大瑕疵，非第三人的真实意思表示，因此确认银行持有的他项权证无效。

2. 抵押登记手续存在程序瑕疵：

   • 抵押登记手续必须严格遵守相关法律法规和程序规定。若在办理过程中存在程序瑕疵，如未提供完整的权属证明文件、未进行实地勘察等，法院可能会认为他项权证的颁发不符合法律规定，从而确认其无效。例如，在某案例中，银行以某块土地作为抵押物发放贷款，并办理了土地他项权证。然而，在抵押登记过程中存在程序瑕疵，如未提供完整的权属证明文件。最终，法院认为这些程序瑕疵导致他项权证的颁发不符合法律规定，因此确认该他项权证无效。

3. 抵押物权属存在争议：

   • 若抵押物的权属存在争议，如涉及共有权人异议、继承纠纷等，且该争议直接影响到抵押权的设立和行使，法院可能会在解决权属争议后，根据争议结果判断他项权证的有效性。虽然这种情况不直接导致他项权证无效，但权属争议的解决结果可能影响他项权证的效力。例如，若抵押物存在共有权人，且共有权人未同意抵押，那么在共有权人提出异议并得到法院支持的情况下，他项权证可能会被认定无效。

法律建议：

• 严格审查抵押登记文件和手续：金融机构在办理抵押登记时，应严格审查当事人的身份和授权文件，确保抵押登记行为合法有效。同时，应确保抵押登记手续完整、合规，避免出现程序瑕疵。
• 及时解决权属争议：若抵押物存在权属争议，应及时解决争议，确保抵押权的设立和行使不受影响。在争议解决前，应谨慎办理抵押登记和他项权证。
• 寻求专业法律帮助：在涉及抵押登记和他项权证的问题时，建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、协助审查文件、参与诉讼等法律服务，确保当事人的合法权益得到维护。

可能法律后果：

• 若他项权证被法院认定无效，那么基于该他项权证的抵押权将无法行使，相关权益可能无法得到实现。这可能导致金融机构无法收回贷款本息，给金融机构带来经济损失。因此，在办理抵押登记和他项权证时，必须严格遵守相关法律法规和程序规定，确保合法合规。