在刑事犯罪中，违法犯罪所得的追缴机关主要是公安机关、人民检察院和人民法院，但最终决定追缴及处理的机关是人民法院。以下是对这一问题的详细分析：

一、公安机关的角色

1. 侦查阶段的追缴：公安机关作为侦查机关，在刑事案件侦查过程中，有责任查明与案件相关的违法犯罪所得情况，并依法予以追缴。这是公安机关的法定职责，旨在恢复原状、保护受害者权益和维护社会经济秩序。公安机关会通过多种方式开展追缴工作，如调查犯罪嫌疑人的资金流向、搜查住所及相关场所、查封扣押涉案财物等。
2. 查封、扣押、冻结措施：在侦查过程中，公安机关有权对犯罪嫌疑人的违法所得财物进行查封、扣押、冻结，以防止其转移或隐匿。这些措施是追缴违法犯罪所得的重要手段。

二、人民检察院的监督

1. 审查起诉阶段的监督：人民检察院在审查起诉阶段，会对公安机关的追缴情况进行监督，并提出意见。这有助于确保追缴工作的合法性和有效性，防止公安机关滥用职权或疏忽职守。
2. 必要时采取措施：在特定情况下，如发现公安机关未依法追缴或追缴不力时，人民检察院也可以采取相关措施，如要求公安机关补充侦查或自行采取追缴措施。

三、人民法院的决定权

1. 审判阶段的最终决定：虽然公安机关和人民检察院在追缴违法犯罪所得中扮演着重要角色，但最终是否追缴及如何处理需由人民法院在审判阶段决定。人民法院会根据案件事实和法律规定，在判决中明确违法所得的追缴情况。
2. 执行阶段的追缴：在执行阶段，如果发现新的应当追缴的财物，同样由人民法院依法裁定进行追缴。这体现了人民法院在追缴违法犯罪所得中的最终决定权。

四、特殊情况下的处理

1. 犯罪嫌疑人、被告人死亡的情况：如果犯罪嫌疑人、被告人死亡，依照刑法规定应当追缴其违法所得及其他涉案财产的，由人民检察院向人民法院提出没收违法所得的申请，启动特别程序进行审理。
2. 第三人涉及的情况：如果第三人明知是犯罪所得而予以窝藏、转移、收购、代为销售或者以其他方法掩饰、隐瞒的，司法机关也可依法对其涉及的财物进行追缴。

举例说明：假设某犯罪嫌疑人因涉嫌诈骗罪被公安机关立案侦查。在侦查阶段，公安机关对其违法所得的部分财物进行了查封、扣押。案件移送至法院审判时，法院会根据查明的案件事实，在判决中明确哪些财物属于违法所得并作出追缴的判决。如果在执行阶段又发现了该犯罪嫌疑人之前未被发现的一笔违法所得款项，那么同样由法院依法裁定进行追缴。

综上所述，刑事犯罪中的违法犯罪所得追缴是一个涉及多个司法机关的过程，但最终决定权在人民法院。如果您对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。