共同犯罪案件中，被告是否可以分别开庭，需根据具体情况判断，原则上应合并审理，但在特定情形下可分别审理。以下是对此问题的详细分析：
一、合并审理为原则
法律依据与司法实践：
- 根据我国相关法律规定及司法实践，共同犯罪案件一般应当合并审理。这是因为共同犯罪中各被告人的行为紧密关联，合并审理有助于全面、清晰地查明整个犯罪事实，准确认定各被告人在共同犯罪中的地位、作用及应承担的刑事责任。
- 合并审理还能提高诉讼效率，节约司法资源，避免重复调查、举证等工作，减少当事人的讼累。
庭审过程中的处理：
- 在法庭审理的调查阶段，即使需要对不同被告人分别进行调查，这仍属于一个审理程序过程中，不属于分开审理。法院会在同一判决书中对所有被告人一并进行判决。
二、分别审理为例外
特定情形下的分别审理：
- 另有重大犯罪事实：当部分共同犯罪嫌疑人除了与其他嫌疑人共同实施的犯罪之外，还涉及其他重大犯罪事实，且这些犯罪事实较为复杂、调查取证难度大、所需时间长时，为了不影响对其他共同犯罪嫌疑人的及时审判，可以对该部分嫌疑人的案件进行分案审理。
- 存在利益冲突：若共同犯罪人之间存在利益冲突，可能影响庭审顺利进行，例如部分被告人的辩护策略可能会对其他被告人不利，为避免这种利益冲突对审判造成干扰，法院可以决定分别审理。
- 涉未成年人犯罪：在共同犯罪案件中，若包含未成年人和成年人，为了保护未成年人的合法权益，遵循教育、感化、挽救的方针和教育为主、惩罚为辅的原则，通常会将未成年人与成年人的案件分开审理。
- 案件存在牵连、合并管辖等情况：当案件存在牵连关系或需要合并管辖时，为了保障诉讼效率和公正审判，法院在必要时也可以决定对共同犯罪案件中的部分被告人实行分案审理。
分别审理需遵循的原则：
- 保障当事人诉讼权利：无论是否分案审理，都必须充分保障每一名被告人的各项诉讼权利，包括辩护权、质证权、上诉权等。在分案审理过程中，应确保被告人能够及时获得法律帮助，为其指定合适的辩护人。
- 确保司法公正和效率：分案审理的目的是为了更好地实现司法公正和提高诉讼效率，而不是为了简化程序或规避问题。法院在决定是否分案审理时，需综合考虑案件的具体情况，权衡利弊，做出合理的决策。
三、法律建议
- 对于被告人：如果认为自己或同案犯存在上述可分别审理的情形，可以在庭审前或庭审过程中向法院提出申请，说明理由并提供相关证据。
- 对于法院：在决定是否分别审理时，应严格遵循法律规定和司法原则，确保审判的公正性和效率性。同时，应充分保障被告人的诉讼权利，避免因分别审理而损害其合法权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律意见。