在处理本诉与反诉互负给付金钱义务的情况时，申请执行的金额并非简单地全额执行或扣减后金额，而是需要根据具体情况和法律规定来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律规定与原则
在民事诉讼中，本诉与反诉是两个独立的诉讼请求，但它们可能涉及相互关联的债权债务关系。当本诉与反诉均涉及金钱给付义务时，执行法院在处理执行申请时，会遵循相关法律规定和原则，确保执行的公正性和合理性。
二、全额执行与扣减后金额的考量
全额执行：
- 如果本诉与反诉的金钱给付义务是独立的，即一方要求另一方支付某一金额，而另一方提出的反诉也要求对方支付另一笔金额，且这两笔金额之间没有直接的抵销关系，那么执行法院可能会分别对本诉和反诉的判决进行全额执行。
- 但这种情况下，执行法院也会考虑双方的实际履行能力和经济状况，避免过度执行导致一方生活困难或经营受阻。
扣减后金额执行：
- 如果本诉与反诉的金钱给付义务存在相互抵销的关系，即一方的给付义务可以抵销另一方的给付义务，那么执行法院在处理执行申请时，可能会考虑将双方的给付义务进行扣减，然后执行扣减后的金额。
- 这种做法有助于简化执行程序，减少执行成本，同时确保双方权益的平衡。例如，如果本诉判决被告支付原告10万元，而反诉判决原告支付被告6万元，那么执行法院可能会执行被告向原告支付4万元的差额。
三、实际操作中的注意事项
明确债权债务关系：
- 在申请执行前，双方应明确本诉与反诉的债权债务关系，包括金额、履行期限等，以便执行法院准确判断是否可以扣减以及扣减的金额。
提交相关证据：
- 双方在申请执行时，应提交相关证据证明本诉与反诉的债权债务关系以及是否存在抵销的情况。这些证据可能包括判决书、合同、发票等。
遵循执行程序：
- 无论选择全额执行还是扣减后金额执行，双方都应遵循执行程序的规定，如提交执行申请、参加执行听证等。
考虑执行和解：
- 在执行过程中，双方也可以考虑通过执行和解的方式解决纠纷。执行和解是指双方在执行过程中自愿达成协议，就执行标的、履行方式等达成一致意见，从而终结执行程序。
四、法律建议
- 在处理本诉与反诉互负给付金钱义务的情况时，建议双方先尝试通过协商或调解解决纠纷。这有助于减少诉讼成本和时间，同时维护双方的关系。
- 如果协商或调解无果，双方应依法向法院提起诉讼并申请执行。在申请执行时，应明确申请执行的金额和依据，并提交相关证据。
- 在执行过程中，双方应积极配合执行法院的工作，如提供财产线索、参加执行听证等。同时，也可以考虑通过执行和解的方式解决纠纷。
如果有任何关于本诉与反诉互负给付金钱义务执行问题的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况和法律规定，为您提供专业的法律建议和解决方案。