针对您提出的“有出租车资格证但没注册会如何处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，根据《出租汽车驾驶员从业资格管理规定》的相关条款，取得从业资格证的出租汽车驾驶员，必须经过出租汽车行政主管部门的从业资格注册后，才能从事出租汽车客运服务。这是从事出租车运营的基本前提和法定要求。

若驾驶员未按照规定办理注册手续而驾驶出租汽车从事经营活动，将面临行政处罚。具体的处罚措施和幅度可能因地区和具体违规情况而有所不同，但一般来说，处罚会包括责令改正和罚款。

以广东省和临夏州的案例为例，对于未办理注册手续驾驶出租汽车从事经营活动的驾驶员，相关部门会责令其改正，并处以一定金额的罚款。在广东省的案例中，罚款金额范围在200元以上2000元以下；而在临夏州的案例中，由于驾驶员违反了相关规定，且考虑到其积极主动配合的态度，执法人员对其处以了1000元的行政处罚。

因此，如果您持有出租车资格证但未进行注册，建议您尽快前往当地出租汽车行政主管部门办理注册手续，以避免可能的行政处罚和不必要的经济损失。同时，也请您务必遵守相关法律法规和行业规定，确保合法合规地从事出租车运营服务。