公司员工作假报关单可能涉及刑事犯罪及行政处罚，具体判定需结合行为性质、后果及主观意图，分情况说明如下：

1. 刑事责任：伪造、变造国家机关公文、证件、印章罪

   • 法律依据：根据《刑法》第280条，伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章的，处3年以下有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处3-10年有期徒刑，并处罚金。
     
   • 适用情形：若员工伪造报关单（如篡改货物名称、数量、价值等信息），且该行为导致海关误判、偷逃税款或扰乱市场秩序，可能构成此罪。
     
   • 关键点：需证明员工主观上存在故意（如为谋取私利或掩盖违规行为），且伪造行为与危害结果存在因果关系。
     

2. 刑事责任：走私普通货物、物品罪（共犯）

   • 法律依据：根据《刑法》第153条，走私货物、物品偷逃应缴税额较大或一年内曾因走私被给予二次行政处罚后又走私的，构成走私罪。
     
   • 适用情形：若员工伪造报关单的目的是协助公司走私（如低报价格、隐瞒货物性质），且偷逃税款达到法定标准（个人10万元以上，单位20万元以上），可能作为走私罪的共犯被追责。
     
   • 关键点：需证明员工与走私行为存在共同故意（如明知公司走私仍参与伪造单据），且其行为对走私结果起推动作用。
     

3. 行政处罚：违反海关监管规定

   • 法律依据：根据《海关法》第86条，违反海关监管规定（如伪报、瞒报）的，可处警告、罚款；情节严重的，可没收违法所得、暂停报关资格或吊销报关员证。
     
   • 适用情形：若员工伪造报关单但未达到刑事立案标准（如偷逃税款不足10万元），或行为性质较轻（如仅因疏忽导致单据错误），可能仅受行政处罚。
     
   • 关键点：需区分故意与过失。故意伪造可能面临更严厉处罚，过失导致单据错误则处罚较轻。
     

4. 民事责任：公司连带赔偿

   • 法律依据：根据《民法典》第1191条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任；用人单位承担侵权责任后，可向有故意或重大过失的工作人员追偿。
     
   • 适用情形：若员工伪造报关单导致公司被海关处罚或第三方索赔，公司可能先承担赔偿责任，后向员工追偿。
     

建议：

• 若涉及刑事风险，需立即停止行为并配合调查，争取从轻情节（如自首、立功）；
  
• 若仅涉及行政处罚，需主动整改并补缴税款，降低处罚幅度；
  
• 公司应完善内部合规制度，加强单据审核，避免员工个人行为引发连带责任。
  

如有具体案件细节（如伪造目的、金额、后果等），可进一步分析法律风险及应对策略。