行政机关在特定条件下可以单方变更拆迁协议，其法律依据主要为《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》第十六条。以下是对此问题的详细分析：
一、行政机关单方变更拆迁协议的法律依据
根据《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》第十六条：“在履行行政协议过程中，可能出现严重损害国家利益、社会公共利益的情形，被告作出变更、解除协议的行政行为后，原告请求撤销该行为，人民法院经审理认为该行为合法的，判决驳回原告诉讼请求”。这一条款明确了行政机关在特定条件下可以单方变更或解除行政协议的权利。
二、行政机关单方变更拆迁协议的条件
严重损害国家利益、社会公共利益：
- 行政机关单方变更拆迁协议的前提是，继续履行原协议将严重损害国家利益或社会公共利益。例如，在拆迁过程中，如果发现被拆迁人存在抢栽抢种等行为，导致补偿金额有误，继续履行原协议将导致国家财政多支出补偿款，从而损害国家利益。
无法与相对人协商一致：
- 行政机关在变更拆迁协议前，应尝试与相对人进行协商。如果协商无果，且继续履行原协议将严重损害国家利益或社会公共利益，行政机关可以单方变更协议。
三、行政机关单方变更拆迁协议的案例分析
以某县XX镇人民政府与王某的拆迁补偿协议变更案为例：
案情简介：
- 王某与XX县XX镇人民政府签订了《土地征用及地上附着物补偿协议》。后镇政府发现涉案土地上无任何附着物，但王某在丈量时抢栽抢种了松树苗，导致地上附着物补偿金额有误。镇政府遂作出变更协议的决定，对相关补偿数额进行了变更。
法院判决：
- 法院经审理认为，镇政府与王某签订的协议依据的基础事实发生重大变化，如果继续履行变更前的协议会导致国家财政多支出土地征收补偿款，从而损害国家利益、社会公共利益。因此，镇政府依法可以依职权进行更正，其作出的变更决定事实清楚、证据确凿、依法应予维持。
四、法律建议
对于行政机关：
- 在变更拆迁协议前，应充分评估继续履行原协议是否可能严重损害国家利益或社会公共利益。
- 尝试与相对人进行协商，如果协商无果且符合变更条件，再依法单方变更协议。
- 变更协议后，应及时将变更决定送达相对人，并确保送达程序的合法性。
对于被拆迁人：
- 在签订拆迁协议时，应仔细阅读协议条款，确保自己的权益得到充分保障。
- 如果发现行政机关单方变更协议的行为可能损害自己的权益，可以依法提起行政诉讼或申请行政复议来维护自己的合法权益。
如有任何关于拆迁协议或行政机关单方变更协议的疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。