破坏耕地案件中，做笔录的人员通常为公安机关或自然资源部门的工作人员，具体需根据案件性质和调查主体确定。以下是详细说明：

1. 公安机关介入时
   若破坏耕地行为涉嫌刑事犯罪（如非法占用农用地罪），公安机关会依法立案侦查。此时，办案民警会制作询问笔录或讯问笔录，记录涉案人员陈述、证人证言等关键信息。笔录需由两名以上民警执行，并确保被询问人签字确认。

2. 自然资源部门调查时
   若破坏耕地行为未达刑事标准，但违反《土地管理法》等行政法规，自然资源部门（如国土资源局）会启动行政调查。执法人员会制作调查笔录，记录违法事实、证据等，作为行政处罚的依据。笔录需由执法人员和被调查人共同签字。

3. 关键注意事项

   • 笔录合法性：无论由谁制作，笔录必须符合法定程序（如出示证件、告知权利义务），否则可能影响证据效力。
     
   • 配合义务：涉案人员或证人需如实陈述，隐瞒或伪造证据可能承担法律责任。
     
   • 律师介入：若您涉及此类案件，建议及时委托律师协助处理，确保笔录内容合法、权益不受侵害。

如有具体案件或疑问，可直接向我咨询，我将结合事实与法律提供专业分析。