自己开垦的荒地被纳入基本农田，其合法性需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、荒地开垦的合法性基础
土地所有权性质：
- 农村土地属于集体所有，个人未经合法程序不得擅自开垦。若荒地属于农村集体所有，且未经相关部门批准，个人开垦行为可能存在合法性问题。
- 国有土地上的荒地开垦，同样需符合土地利用规划等相关规定，否则也可能不被认可。
历史原因与地域差异：
- 在一些偏远地区，由于历史原因或当地实际情况，对于一些未被明确划定用途的土地，个人的开垦行为可能在一定时期内被默许。但这并不意味着这种行为绝对合法，一旦相关部门进行清查或土地用途发生变化，可能会面临被要求恢复原状等情况。
二、纳入基本农田的合法性分析
基本农田的定义与保护：
- 基本农田是指按照一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求，依据土地利用总体规划确定的不得占用的耕地。其保护受到法律的严格限制，未经批准不得擅自改变用途。
纳入基本农田的程序：
- 若荒地被纳入基本农田，通常需经过土地利用总体规划的调整和审批程序。这一过程中，相关部门会考虑土地的性质、用途、生态价值等多方面因素。
- 若个人开垦的荒地未经合法程序即被纳入基本农田，且个人未获得相应补偿或安置，则可能涉及违法问题。
三、可能的法律后果与建议
法律后果：
- 若个人开垦的荒地被非法纳入基本农田，且个人未获得合法补偿，个人有权要求相关部门进行纠正，并可能获得相应的赔偿。
- 同时，若个人开垦行为本身存在违法问题（如未经批准开垦集体所有土地），也可能面临行政处罚或民事责任。
建议：
- 核实土地性质：首先，应核实所开垦荒地的性质（集体所有还是国有）以及是否已被纳入基本农田。
- 咨询相关部门：若对土地性质或纳入基本农田的程序有疑问，可咨询当地土地管理部门或农业部门，了解具体情况和政策要求。
- 寻求法律帮助：若认为自身权益受到侵害，可寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自身合法权益。
总结来看，自己开垦的荒地被纳入基本农田的合法性需根据土地性质、开垦程序以及纳入基本农田的程序等多方面因素综合判断。若存在疑问或认为自身权益受到侵害，建议及时咨询相关部门或专业律师以获取准确信息和法律帮助。如有任何房产纠纷或刑事辩护方面的法律问题，也可以直接向我咨询。