在建设工程施工纠纷中，是否会查封实控人资产，需结合具体情况分析，不能一概而论。以下从不同角度进行详细阐述：

1. 查封实控人资产的法律基础与前提

• 法律基础：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，法院在执行程序中，有权查封、扣押、冻结被执行人的财产。这里的“被执行人”通常指诉讼中的败诉方或仲裁裁决的义务履行方。若实控人个人被列为被执行人（如因个人担保、个人债务等），则其资产可能被查封。
• 前提条件：查封实控人资产的前提是，实控人个人与纠纷存在直接法律关系，或其财产被认定为可供执行的财产。若实控人仅作为公司股东或高管，未以个人财产为公司债务提供担保，且公司财产与个人财产独立，则一般不能直接查封其实控人资产。

2. 公司债务与实控人资产的关系

• 公司独立法人地位：根据《公司法》，公司具有独立法人地位，以其全部财产对公司债务承担责任。股东（包括实控人）仅以其出资额为限对公司承担责任。因此，在一般情况下，公司债务不应直接涉及实控人个人资产。
• 例外情形：若实控人存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的行为（如财产混同、人格混同），则可能根据《公司法》第二十条的规定，被“刺破公司面纱”，对公司债务承担连带责任。此时，实控人个人资产可能被查封。

3. 执行程序中的具体操作

• 财产调查：在执行程序中，法院会要求被执行人申报财产，并可能通过查询、冻结、划拨等措施执行被执行人财产。若实控人个人被列为被执行人，或其财产被认定为可供执行的财产，则可能被查封。
• 协助执行：若实控人控制的公司或其他主体持有实控人个人财产，或实控人通过其他方式隐匿、转移财产，法院可能要求相关主体协助执行，查封、扣押、冻结相关财产。

4. 实务建议

• 区分主体：在建设工程施工纠纷中，应明确纠纷主体是公司还是个人。若涉及公司债务，一般不应直接查封实控人个人资产。
• 证据收集：若认为实控人存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任的行为，应收集相关证据，如财产混同、人格混同的证据，以便在诉讼或执行程序中主张实控人承担连带责任。
• 法律程序：在执行程序中，若发现实控人个人财产可能被查封，应及时向法院提出异议，并提供相关证据证明财产归属或执行不当。

总结来看，建设工程施工纠纷中是否会查封实控人资产，取决于实控人个人是否与纠纷存在直接法律关系，以及其实控人财产是否被认定为可供执行的财产。若您面临此类问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议。