在网贷逾期后协商一次性还款达成共识的情况下，要求网贷公司先出具结清证明是合理的，且从保护自身权益的角度出发，这一做法是正确的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与依据
在金融借贷关系中，结清证明是证明借款人已履行完毕还款义务的重要法律文件。它不仅是借款人还清债务的凭证，也是避免未来可能出现的纠纷（如网贷公司错误主张债权、影响个人征信等）的关键证据。虽然现行法律法规并未明确规定在协商还款时必须先出具结清证明，但从法律原则和实务操作来看，要求先出具结清证明是符合逻辑且有利于保护借款人权益的。
二、从借款人权益保护角度
避免后续纠纷：在协商一次性还款后，如果网贷公司未及时出具结清证明，而借款人又已实际支付了款项，那么在未来一段时间内，借款人可能面临网贷公司再次主张债权的风险。这种风险在实务中并不罕见，尤其是当网贷公司内部管理混乱或存在恶意行为时。因此，要求先出具结清证明可以有效避免这种后续纠纷。
维护个人征信：结清证明对于维护个人征信至关重要。如果借款人已还清债务但未获得结清证明，那么在征信系统中可能仍显示为未结清状态，这将影响借款人未来的信用评级和贷款申请。因此，从维护个人征信的角度出发，要求先出具结清证明也是必要的。
三、实务操作建议
明确协商内容：在协商一次性还款时，借款人应明确要求网贷公司出具结清证明，并将此作为协商的重要条件之一。同时，双方应就还款金额、还款时间、结清证明的出具时间等关键条款达成书面协议。
保留相关证据：在协商和还款过程中，借款人应保留好所有相关证据，如协商记录、转账凭证、结清证明等。这些证据将在未来可能出现的纠纷中发挥关键作用。
及时跟进：在还款后，借款人应及时跟进结清证明的出具情况。如果网贷公司未按时出具结清证明，借款人应主动联系并催促其尽快出具。
四、可能的法律后果
如果借款人已按照协商结果支付了款项，但网贷公司拒绝出具结清证明或拖延出具，借款人可以采取以下法律措施：
向监管部门投诉：借款人可以向相关金融监管部门投诉网贷公司的违规行为，要求其督促网贷公司出具结清证明。
提起诉讼：如果投诉无果，借款人可以向人民法院提起诉讼，要求网贷公司履行出具结清证明的义务，并可能要求其承担因未出具结清证明而给借款人造成的损失。
总结来看，在网贷逾期后协商一次性还款达成共识的情况下，要求网贷公司先出具结清证明是合理且正确的做法。这不仅有利于保护借款人的合法权益，也有助于避免未来可能出现的纠纷。如果您在实务操作中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。