公司发现印章被伪造后，可依法通过刑事控告、民事索赔、行政举报三方面主张权利，具体操作及法律依据如下：

一、刑事控告：追究伪造者刑事责任

1. 法律依据
   根据《刑法》第280条，伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利，并处罚金。若伪造印章用于合同诈骗等犯罪，还可能构成其他罪名（如合同诈骗罪）。

2. 操作步骤

   • 固定证据：收集伪造印章的实物、使用记录（如合同、文件）、鉴定意见（证明印章系伪造）；
     
   • 向公安机关报案：提交报案材料（包括证据清单、公司营业执照、法定代表人身份证明等）；
     
   • 配合调查：协助公安机关鉴定印章真伪、追踪伪造者身份及行为轨迹。

3. 效果
   刑事立案后，公安机关会依法追究伪造者刑事责任，同时可追缴违法所得，为公司后续民事索赔提供依据。

二、民事索赔：要求伪造者赔偿损失

1. 法律依据
   根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应承担侵权责任。公司可主张因伪造印章导致的直接损失（如合同违约赔偿、诉讼费用）及间接损失（如商誉损害）。

2. 操作步骤

   • 发送律师函：要求伪造者停止侵害、赔偿损失；
     
   • 提起民事诉讼：向法院提交起诉状、证据材料（包括伪造印章的合同、损失计算依据等）；
     
   • 申请财产保全：防止伪造者转移财产，确保判决执行。

3. 效果
   法院判决后，公司可要求伪造者赔偿经济损失，若伪造者拒不履行，可申请强制执行。

三、行政举报：要求市场监管部门查处

1. 法律依据
   根据《公司登记管理条例》第79条，伪造、涂改、出租、出借、转让营业执照的，由公司登记机关处以1万元以上10万元以下罚款；情节严重的，吊销营业执照。虽未直接规定印章伪造，但若伪造印章用于非法经营，可向市场监管部门举报。

2. 操作步骤

   • 提交举报材料：包括伪造印章的证据、使用场景（如虚假注册公司）；
     
   • 要求查处：请求市场监管部门对伪造者进行行政处罚。

3. 效果
   行政处罚可对伪造者形成威慑，同时为公司后续民事索赔提供行政认定依据。

实务建议

1. 优先固定证据：发现印章被伪造后，立即封存相关文件，委托鉴定机构出具印章真伪鉴定报告；
   
2. 同步启动刑事+民事程序：刑事控告可快速打击犯罪，民事索赔可弥补损失，两者结合效率更高；
   
3. 防范风险扩散：及时公告印章作废，防止伪造者继续使用，同时检查公司内部印章管理制度是否存在漏洞。

如有具体案件细节（如伪造印章用途、损失金额等），可进一步向我咨询，我会结合证据为您制定详细维权方案。