您好，针对您提出的“建设工程施工合同约定先开发票后付款是否合法”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律原则与合同约定
在建设工程施工合同中，双方约定先开发票后付款，从法律原则上看，并不直接违反法律法规的强制性规定。合同是双方真实意思表示的体现，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，且双方具备相应的民事行为能力，合同即具有法律效力。因此，如果合同中明确约定了先开发票后付款的条款，且该约定是双方真实、自愿的意思表示，那么该约定是合法的。
二、发票与付款义务的对等性
然而，需要注意的是，发票的开具与工程款的支付在法律上并不构成严格的对等义务。发票是收款方开具给付款方的收款凭证，是税务管理的重要环节；而工程款的支付则是发包方根据合同约定应履行的付款义务。虽然两者在合同中可能被关联起来，但它们的经济价值和法律性质并不相同。
三、司法实践中的认定
在司法实践中，对于合同中约定的“先票后款”条款，法院通常会根据具体情况进行认定。如果合同中明确约定了“承包人应开具足额发票，否则发包人有权拒付工程款”，且该约定是双方真实意思表示，那么法院可能会认可发包方在承包方未开具发票时有权拒付工程款。但是，如果合同中的约定不够明确，或者存在歧义，法院可能会倾向于保护相对弱势方的利益，即承包方的利益，认为发票的开具不应成为发包方拒付工程款的唯一理由。
四、风险提示与应对建议
对于发包方：在签订合同时，应明确约定发票的开具与工程款支付的先后顺序及违约责任，以避免因约定不明确而导致的法律风险。同时，在承包方未开具发票时，应及时与承包方沟通并催促其开具发票，以避免因拖延而导致的额外损失。
对于承包方：在签订合同时，应仔细审查合同中的发票开具条款，评估风险后再决定是否接受。如果合同中存在不合理的“先票后款”约定，承包方可以考虑与发包方协商修改或提出异议。在合同履行过程中，如果发包方以未开具发票为由拒付工程款，承包方应及时与发包方沟通并寻求法律途径解决。
综上所述，建设工程施工合同中约定先开发票后付款在法律上并不直接违法，但具体是否合法还需根据合同内容、双方意思表示以及司法实践中的认定来判断。因此，在签订合同时，双方应明确约定相关条款并评估风险后再做决定。