法院最终判决的赔偿金和年休假工资结算，对于已开除的员工，其个税缴纳问题需分情况讨论：

1. 赔偿金部分：

   • 经济补偿金：根据《财政部、国家税务总局关于个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入征免个人所得税问题的通知》（财税〔2001〕157号）规定，个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过的部分按照《国家税务总局关于个人因解除劳动合同取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》（国税发〔1999〕178号）的有关规定，计算征收个人所得税。具体计算方式为：将超过部分视为一次取得数月的工资、薪金收入，允许在一定期限内进行平均。具体平均办法为：以个人取得的一次性经济补偿收入，除以个人在本企业的工作年限数，以其商数作为个人的月工资、薪金收入，按照税法规定计算缴纳个人所得税。个人在本企业的工作年限数按实际工作年限数计算，超过12年的按12年计算。
   • 赔偿金（非经济补偿金性质）：若法院判决的赔偿金并非基于劳动合同解除的经济补偿性质，而是如违法解除劳动合同的赔偿金等，其个税缴纳需根据具体性质判断。一般来说，若赔偿金属于个人因劳动关系解除而获得的收入，且不属于免税范围，则需依法缴纳个人所得税。具体缴纳方式可能需参照经济补偿金的计算方法或根据税务机关的具体规定执行。

2. 年休假工资部分：

   • 年休假工资性质：年休假工资属于员工因未享受年休假而获得的补偿性收入，其性质更接近于工资薪金所得。
   • 个税缴纳：根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，工资薪金所得属于个人所得税的征税范围。因此，员工获得的年休假工资需依法缴纳个人所得税。具体缴纳方式按照工资薪金所得的个税计算方法执行，即根据年休假工资的数额，结合员工的月收入、专项扣除、专项附加扣除等因素，计算应缴纳的个人所得税额。

建议与注意事项：

• 对于已开除的员工，在收到法院判决的赔偿金和年休假工资后，应仔细核对款项性质及金额，并咨询当地税务机关或专业税务人员，以准确了解个税缴纳义务及具体缴纳方式。
• 若对个税缴纳存在疑问或争议，可及时向税务机关提出申诉或咨询，以确保自身权益得到保障。

总结：法院最终判决的赔偿金和年休假工资结算，对于已开除的员工，其个税缴纳问题需根据款项性质及具体金额进行判断。在处理此类问题时，建议员工保持谨慎态度，并咨询专业税务人员或律师以获取准确指导。如有任何法律疑问，欢迎直接向我咨询。