和解协议原件仅此一份在法院仍然有效。以下从多个角度进行详细分析：

一、和解协议的法律性质

和解协议本质上属于合同的一种，其法律效力取决于是否符合合同生效的条件。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效需满足以下条件：

1. 当事人具有相应的民事行为能力：即签订和解协议的双方需具备完全民事行为能力，能够独立进行民事活动。
2. 意思表示真实：双方签订和解协议时，意思表示需真实、自愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 内容不违反法律法规的强制性规定和公序良俗：和解协议的内容需合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。

若和解协议满足上述条件，即使原件仅此一份，也具备法律效力。

二、和解协议原件数量的影响

1. 法律效力不受影响：和解协议的法律效力并不取决于其原件的数量。只要协议内容合法、真实、自愿，且双方均认可，即使只有一份原件，也不影响其法律效力。
2. 证据效力可能受限：然而，从证据的角度来看，如果和解协议原件仅此一份，且由一方保管，那么在发生争议时，另一方可能难以提供有效的证据来支持自己的主张。这可能导致在诉讼或仲裁过程中，证据的呈现和认定存在困难。

三、建议与措施

1. 双方各执一份：为了避免因证据问题而引发的争议，建议双方在签订和解协议时，各自保留一份原件。这样，在发生争议时，双方都能提供有效的证据来支持自己的主张。
2. 公证增强证据效力：如果条件允许，双方还可以将和解协议进行公证。公证是一种具有法律效力的证明方式，能够增强和解协议的证据效力，使其在诉讼或仲裁过程中更具说服力。

四、法律后果

如果一方违反了和解协议的约定，另一方可以凭借有效的和解协议（无论原件数量）去追究违约方的法律责任。然而，在实际操作中，如果和解协议原件仅此一份且由违约方保管，那么守约方在追究违约责任时可能会面临一定的困难。因此，为了更好地维护自己的合法权益，建议双方在签订和解协议时采取上述建议与措施。

综上所述，和解协议原件仅此一份在法院仍然有效，但为了避免因证据问题而引发的争议，建议双方各自保留一份原件或进行公证。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。