盗取功德箱寺院已经罚款了，两个月后仍然有可能面临刑事处罚。以下是我从多个角度进行的分析：

1. 行政处罚与刑事处罚的独立性：

   • 行政处罚（如罚款）和刑事处罚是两种独立的法律责任形式。行政处罚主要针对违反行政管理秩序的行为，而刑事处罚则针对构成犯罪的行为。
   • 即使已经接受了行政处罚，如果行为人的行为同时构成了犯罪，那么仍然有可能面临刑事处罚。这是因为行政处罚并不能替代刑事处罚，两者在性质、目的和适用条件上均有所不同。

2. 盗取功德箱行为的法律性质：

   • 盗取功德箱的行为，如果数额较大或者存在其他严重情节，可能构成盗窃罪。盗窃罪是一种刑事犯罪，需要承担刑事责任。
   • 寺院对行为人进行罚款，并不意味着行为人已经承担了全部的法律责任。如果行为人的行为构成了犯罪，那么寺院无权进行刑事处罚，只能由司法机关依法进行。

3. 刑事处罚的时效性：

   • 刑事处罚并不受行政处罚时间的影响。即使行为人已经接受了行政处罚，只要其行为构成了犯罪，并且在追诉时效内，司法机关仍然可以依法对其进行刑事处罚。
   • 追诉时效是指法律规定的对犯罪人进行刑事追诉的有效期限。在追诉时效内，司法机关有权对犯罪人进行刑事追诉；超过追诉时效的，则不再追诉。但需要注意的是，对于某些严重犯罪，如故意杀人、抢劫等，追诉时效可能会更长或者不受限制。

4. 具体案例与法律适用：

   • 在实际案例中，如果行为人盗取功德箱的数额较大或者存在其他严重情节，被认定为盗窃罪后，即使已经接受了寺院的罚款，仍然有可能面临刑事处罚。
   • 刑事处罚的种类和幅度将根据行为人的犯罪情节、数额大小、社会危害程度等因素进行综合判断。

建议与后续行动：

• 如果您或者他人涉及盗取功德箱的行为，并且已经接受了寺院的罚款，但担心可能面临刑事处罚，建议尽快咨询专业律师（即我本人，刘顺仙律师，专注于刑事辩护领域）进行法律评估。
• 律师将根据您的具体情况，包括行为性质、数额大小、社会危害程度等因素，为您提供专业的法律意见和辩护策略。
• 同时，您也应该积极配合司法机关的调查和审判工作，如实陈述事实，提供相关证据，以便司法机关能够准确判断您的行为性质和法律责任。

希望以上分析能够对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。