针对“犯罪地涉及多个省份的涉企案件由谁管辖”这一问题，结合相关法律法规及实务操作，解答如下：

1. 主要犯罪地公安机关管辖（一般原则）

根据《公安机关跨省涉企犯罪案件管辖规定》，犯罪地涉及多个省份的涉企案件，原则上由主要犯罪地公安机关管辖，并需层报省级公安机关业务主管部门备案。

• 主要犯罪地的认定标准：
  
  • 企业犯罪活动的组织、策划地；
    
  • 主要犯罪活动的实施地。
    
• 例外情形：
  若外省企业在本省设立分支机构，且犯罪由分支机构实施，则分支机构所在地公安机关可管辖该分支机构涉及的犯罪。
  
• 法律优先：若法律、法规对案件管辖有特别规定（如涉及国家安全、专案专办等），则从其规定。

2. 争议管辖的协调与指定（特殊情形）

若对跨省涉企案件的管辖权或侦查措施（如查封、扣押、冻结）适用存在争议，需按以下程序处理：

• 报公安部协调：由争议方公安机关逐级上报，由公安部根据案件实际情况指定管辖。
  
• 指定管辖的考量因素：
  
  • 主要犯罪地优先，但若企业所在地公安机关管辖更利于查清事实、保障权益或提高办案效率，可指定企业所在地公安机关管辖。
    
  • 例如，案件涉及企业核心数据或关键证人位于企业所在地，指定当地管辖可减少取证成本。

3. 重大案件的立案侦查层级（特殊案件）

下列重大跨省涉企犯罪案件，由设区的市一级公安机关立案侦查（直辖市的区县公安机关参照执行）：

1. 涉案企业规模：上市公司或中型以上企业；
   
2. 涉案金额标准：5000万元以上；
   
3. 案件复杂程度：疑难复杂，法律适用存在难点或争议，或存在其他较大执法风险。
   

• 实务意义：此类案件通常涉及面广、社会影响大，由市级公安机关直接办理可确保资源集中、程序规范。

4. 管辖权异议的处理程序（当事人权利）

若当事人（含企业、法定代表人、辩护人等）对管辖权提出异议，公安机关需按以下流程处理：

• 受理与核实：公安机关应及时受理异议，进行调查核实；
  
• 书面回复：自收到异议之日起7个工作日内书面回复当事人；
  
• 申诉权：若异议被驳回，当事人有权向上一级公安机关申诉。
  
• 企业投诉处理：企业可就外省公安机关管辖或违法办案问题向本地公安机关投诉，经审查认为有理的，本地公安机关应向办案地公安机关提出意见，后者需在7个工作日内书面回复。

实务建议

1. 企业应对策略：
   
   • 若发现案件涉及多省，应优先向主要犯罪地或企业所在地公安机关报案，并同步提交管辖权依据（如合同签订地、资金流向等证据）；
     
   • 若对管辖有异议，及时通过书面形式提出，并保留送达回执。
     
2. 公安机关协作：跨省案件中，各地公安机关应通过执法办案信息系统共享案情，避免重复立案或推诿。
   
3. 法律风险防范：企业应完善合规体系，避免因组织架构复杂（如分支机构过多）导致管辖权争议。

总结：跨省涉企案件的管辖以“主要犯罪地”为核心，兼顾办案效率与企业权益保护。若遇争议，可通过公安部协调或指定管辖解决。企业需主动关注管辖动态，必要时通过法律程序维护自身权利。如有具体案件，可进一步向我提供细节，以便针对性分析。