若高铁占地被认定为违建，处理方式需分情况讨论：

1. 若占地行为本身违法（如未取得合法用地手续）
   根据《土地管理法》第七十七条，未经批准或采取欺骗手段骗取批准非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地。若涉及耕地，还可能面临罚款（按占用耕地面积处耕地开垦费5-10倍罚款）。
   关键点：需确认占地是否经过法定审批程序（如征地批复、用地许可），若完全无手续，则属于绝对违法。

2. 若占地手续存在瑕疵但已补办
   实践中，部分项目可能存在“先占后补”情况（如紧急工程）。若后续补办了征地手续、缴纳了土地出让金或补偿款，且符合土地利用总体规划，可能被认定为“程序违法但实体合法”，处罚会减轻或免除。
   关键点：需核查补办手续的合法性及时间节点（是否在占地后合理期限内完成）。

3. 若占地涉及公共利益（如高铁建设）
   根据《民法典》第二百四十三条，为了公共利益的需要，依照法律规定的权限和程序可以征收集体所有的土地和组织、个人的房屋及其他不动产。若占地属于高铁建设等公共利益项目，且已履行征地程序（如发布征地公告、组织听证、支付补偿款），则不属于“违建”，而是合法征收。
   关键点：需确认是否完成“两公告一登记”（征地公告、补偿安置方案公告、土地现状调查登记）及补偿是否到位。

4. 若对“违建”认定有异议
   若认为占地行为合法（如已取得用地许可），可申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销“违建”认定决定。根据《行政复议法》第九条，复议期限为知道具体行政行为之日起60日内；根据《行政诉讼法》第四十六条，诉讼期限为知道或应当知道行政行为之日起6个月内。
   关键点：需在法定期限内主张权利，并提交证据证明占地合法性（如用地批复、规划许可证等）。

建议行动步骤：

• 第一步：要求相关部门出具书面“违建”认定文件，明确法律依据和事实依据；
  
• 第二步：核查占地是否经过法定审批程序（如征地批复、用地许可、环境评价等）；
  
• 第三步：若认为认定错误，及时申请行政复议或提起行政诉讼；
  
• 第四步：若涉及补偿争议，可单独就补偿标准、金额提起行政诉讼或协商解决。
  

提示：高铁占地问题通常涉及行政法、土地管理法、城乡规划法等多部法律，且需结合地方政策（如征地补偿标准）综合判断。若有具体文件或事实细节，可直接向我咨询，我会进一步分析。