收到骑电动车闯红灯被抓拍的短信通知后，您应当及时处理，以下是具体的处理步骤和注意事项：

一、确认短信内容

首先，您需要仔细查看短信内容，确认闯红灯的具体时间、地点以及罚款金额等信息。这些信息对于后续处理至关重要，确保您了解自己的违法行为及后果。

二、查询违法记录及罚款金额

1. 线上查询：您可以通过当地交通管理部门的官方网站或手机APP等渠道查询相关违法记录及罚款金额。这些平台通常提供便捷的查询服务，方便您随时了解自己的交通违法情况。
2. 线下查询：如果您不熟悉线上操作，也可以前往当地交通管理部门进行查询。工作人员会为您提供详细的违法记录及罚款金额信息。

三、缴纳罚款

1. 线上支付：根据短信提示或查询结果，您可以选择线上支付罚款。通常，交通管理部门会提供二维码或支付链接，您只需按照提示完成支付即可。线上支付方便快捷，可以节省您的时间和精力。
2. 线下缴纳：如果您选择线下缴纳罚款，可以前往指定银行或交通管理部门指定的缴费窗口进行缴纳。在缴纳时，请务必携带好相关证件（如身份证、电动车行驶证等），以便工作人员核实您的身份和违法信息。

四、注意事项

1. 及时处理：收到短信通知后，请务必在规定时间内处理违法记录并缴纳罚款。逾期未处理的，可能会产生滞纳金，并影响您的个人交通信用记录。滞纳金的具体金额和计算方式可能因地区而异，但通常都会按照一定比例每日加收。
2. 遵守交通规则：此次闯红灯行为应作为一次警示，提醒您在今后的骑行过程中严格遵守交通规则。逆行、闯红灯、乱穿插等行为不仅影响其他人和车辆的正常通行，还存在巨大的安全隐患。为了您和他人的安全，请务必遵守交通规则。
3. 了解法律后果：根据相关规定，电动车闯红灯属于交通违法行为，一般会处以罚款。具体罚款金额可能因地区而异，但通常都在一定范围内（如20元至50元不等）。此外，如果多次被抓拍不处理，还可能会有民警上门对当事人进行提醒、教育，甚至联合街道、社区工作人员上门进行宣传教育。

五、特殊情况处理

如果您对违法记录有异议或有疑问，可以到辖区交警大队进行申诉。在申诉时，请提供相关证据（如照片、视频等）以支持您的主张。交警部门会依法进行调查和处理，确保您的合法权益得到保障。

总之，收到骑电动车闯红灯被抓拍的短信通知后，请务必及时处理并缴纳罚款。同时，也要以此为戒，遵守交通规则，确保自身及他人的交通安全。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。