您好，针对您提出的“在有合法来源的情况下，办理登记确权手续原则上在什么文件上”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

在办理土地登记确权手续时，若土地来源合法，原则上需要依据一系列相关文件和资料来进行确认。这些文件和资料主要包括但不限于：

1. 政府批准文件：

   • 县级以上人民政府及有关部门批准的国有农场场间土地规划设计文件、组建国有农场的批文和用地批准文件。这些文件是确认土地权属的重要依据，它们证明了土地的合法来源和用途。

2. 用地协议书：

   • 国有农场与周边农民集体和单位签订的用地协议书、土地调整协议书。这些协议书明确了土地的使用权和界线，是办理登记确权手续时不可或缺的文件。

3. 土地权属界线核定书：

   • 依照土地详查形成的土地权属界线核定书。这份文件详细记录了土地的权属界线，是确认土地权属的关键证据。

4. 法律文书：

   • 处理土地权属争议协议书、调解书、决定书和人民法院生效的裁定书、判决书等。这些法律文书在土地权属争议解决过程中发挥了重要作用，它们的存在和内容也是办理登记确权手续时需要考虑的因素。

在办理登记确权手续时，您需要向不动产登记部门提交上述相关文件和资料，以证明土地的合法来源和权属。不动产登记部门会对这些材料进行审核，经公示无异议后，会开展地籍调查工作，并最终为您办理土地登记确权手续。

此外，值得注意的是，不同地区的土地登记确权手续可能略有差异，具体办理流程和所需材料可能因地区而异。因此，在办理前，建议您先咨询当地的不动产登记部门或相关部门，以获取最准确的信息和指导。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。