针对您提出的“三年以下案底封存怎么办理”的问题，这主要涉及到我国未成年人犯罪记录封存制度的相关规定。不过，首先需要明确的是，目前该制度主要针对的是未成年人的犯罪记录，对于成年人的轻微犯罪记录封存，虽然法律有相关程序规定，但具体实施可能因地区和案件性质而异。以下我将结合未成年人犯罪记录封存的相关规定，以及成年人轻微犯罪记录封存的一般程序，为您进行详细解答。
一、未成年人犯罪记录封存
对于未成年人犯罪记录封存，我国有明确的法律规定和实施办法。根据最高人民法院、最高人民检察院、公安部、司法部联合制定的《关于未成年人犯罪记录封存的实施办法》，对于被判处五年有期徒刑以下刑罚以及免予刑事处罚的未成年人犯罪记录，相关部门应当主动予以封存。
办理流程：
诉讼终结后封存：在未成年人刑事案件诉讼终结后，人民法院依法判决后，相关部门（如公安机关、检察机关、审判机关等）应当主动对自己掌握的未成年人相关犯罪记录予以封存。
材料加密与保管：对于封存的案件材料，应当执行个人信息保护法的相关规定，进行加密处理，并执行严格的保管制度。除了纸质卷宗、档案材料等实质化封存外，电子数据也应当同步封存、加密、单独管理。
查询限制：非因法定事由、非经法定程序，不得向任何单位和个人提供未成年人涉罪记录。对于有关单位和个人查询关于未成年人犯罪记录的申请，需要认真审核申请理由、依据和目的，严格把关。
二、成年人轻微犯罪记录封存
对于成年人的轻微犯罪记录封存，虽然目前没有像未成年人那样统一的实施办法，但法律上也有相关程序规定。一般来说，申请轻微犯罪记录封存需要满足一定的条件，并按照规定的流程进行申请。
办理流程（以一般情况为例）：
咨询公安机关：首先，您可以向当地公安机关咨询关于轻微犯罪记录封存的具体规定和申请流程。公安机关会向您提供具体的指导。
准备申请材料：根据公安机关的指导，准备申请材料。这些材料通常包括申请书（说明申请封存犯罪记录的理由和目的）、身份证明文件（如身份证）等。如果有其他需要说明的情况或支持申请的理由和目的的法律文件或证明材料，也可以一并提交。
提交申请并等待审批：将准备好的申请材料提交给公安机关，并按照规定的流程进行申请。在提交申请后，需要耐心等待审批结果。如果审批通过，公安机关会将犯罪记录进行封存，并告知申请人。如果审批不通过，申请人可以根据具体情况进行申诉或者寻求其他途径解决问题。
保持沟通与跟进：在审核期间，需要保持与公安机关的沟通，了解最新进展。如果需要等待较长时间才能获知审批结果，也应持续跟进。
三、注意事项
封存条件：无论是未成年人还是成年人，申请犯罪记录封存都需要满足一定的条件。这些条件可能因地区和案件性质而异，因此需要具体了解当地的规定。
法律程序：申请犯罪记录封存需要遵循一定的法律程序。在申请过程中，需要保持耐心和积极配合相关部门的工作。
保密义务：一旦犯罪记录被封存，相关人员和单位都负有保密义务。不得违反规定泄露相关信息，否则将依法追究法律责任。
综上所述，对于“三年以下案底封存怎么办理”的问题，如果是未成年人的犯罪记录，且被判处五年有期徒刑以下刑罚或免予刑事处罚，相关部门会主动予以封存。如果是成年人的轻微犯罪记录，则需要根据当地的具体规定和申请流程进行申请。在申请过程中，需要准备充分的申请材料，并遵循规定的法律程序。