贩毒没收后的车辆会被依法上缴国库。具体处理方式如下：

1. 作案工具的认定与没收：

   • 根据《刑法》第六十四条，若车辆被认定为实施贩毒犯罪的作案工具，如专门用于毒品交易运输，则会被视为供犯罪所用的本人财物，依法予以没收。

2. 没收后的处理：

   • 被没收的车辆，作为违法所得或供犯罪所用的财物，会依法上缴国库，不得挪用或自行处理。这意味着，车辆不再属于原车主，而是成为国家财产。

3. 法律程序的保障：

   • 在车辆被没收前，司法机关会进行严格的调查和取证，确保车辆确实与贩毒犯罪有关。车主也有权通过法律程序进行申诉或辩护，以维护自身合法权益。

综上所述，贩毒没收后的车辆会被依法上缴国库，这是法律对贩毒行为的一种严厉制裁。同时，法律也确保了车主在车辆被没收前的合法权益得到保障。