严重逾期款项还清后，能否申请公积金贷款需分情况讨论，具体结论及分析如下：

1. 若逾期记录已超过5年，通常不影响公积金贷款申请

根据《征信业管理条例》第十六条，征信机构对个人不良信息的保存期限为自不良行为终止之日起5年。若逾期记录已满5年，征信系统将自动删除该记录，此时公积金中心在审核贷款时，通常无法查询到逾期信息，因此不会因历史逾期拒绝贷款申请。但需注意：

• 公积金中心可能额外审查：部分地区公积金中心会要求申请人提供书面说明，解释逾期原因及还款情况，需提前准备相关材料（如还款凭证、银行流水等）。
  
• 其他贷款条件需满足：即使逾期记录已消除，仍需符合公积金贷款的其他要求，如连续缴存公积金满6个月、收入稳定、负债率合理等。

2. 若逾期记录未满5年，可能影响贷款申请，但并非绝对拒绝

若逾期记录仍在征信报告上显示（未满5年），公积金中心会综合评估逾期次数、金额、时间等因素：

• 轻微逾期（如1-2次，且金额较小）：部分公积金中心可能接受申请，但会要求提供更多证明材料（如还款计划、收入证明等），以证明当前还款能力。
  
• 严重逾期（如连续3个月以上逾期，或累计6次以上）：即使已还清，公积金中心可能以“信用风险较高”为由拒绝贷款申请，或要求提高首付比例、缩短贷款期限等。
  
• 地区政策差异：不同城市公积金中心对逾期记录的容忍度不同。例如，一线城市可能更严格，而二三线城市可能相对宽松。建议提前咨询当地公积金中心，了解具体政策。

3. 建议采取的补救措施

若逾期记录未满5年，可通过以下方式提高贷款成功率：

• 提供还款证明：向公积金中心提交逾期款项的还款凭证（如银行结清证明、还款流水等），证明已履行还款义务。
  
• 增加共同借款人：若个人信用记录不佳，可添加配偶或父母作为共同借款人，利用其良好信用记录提高通过率。
  
• 优化负债结构：提前偿还其他贷款或信用卡欠款，降低负债率，证明具备还款能力。
  
• 等待逾期记录消除：若时间允许，可等待逾期记录满5年后自动删除，再申请贷款。

总结：严重逾期还清后能否申请公积金贷款，需结合逾期记录是否满5年、当地政策及个人其他条件综合判断。建议提前查询征信报告，了解逾期情况，并咨询当地公积金中心获取针对性指导。如有进一步疑问，可直接向我咨询。