将安全辐射许可证挂靠在别人公司，且未经允许，一旦被查出来，可能会面临以下严重的法律后果：
行政处罚：
- 根据相关法律法规，对于未经许可擅自从事需要取得许可证的活动，或者伪造、变造、转让许可证的行为，监管部门有权进行行政处罚。这可能包括罚款、没收违法所得、责令停产停业、吊销许可证等措施。具体到安全辐射许可证的挂靠行为，如果被认定为非法转让或许可证使用，很可能面临上述处罚。
民事责任：
- 挂靠行为可能涉及合同违约或侵权。如果挂靠协议本身违法或无效，挂靠方和被挂靠方都可能因违反合同约定而承担民事责任。此外，如果因挂靠行为导致第三方受损，如因辐射泄漏造成的人身伤害或财产损失，挂靠方和被挂靠方可能需共同承担赔偿责任。
刑事责任：
- 在某些严重情况下，挂靠行为可能构成犯罪。例如，如果挂靠行为涉及伪造、变造国家机关证件，或者因挂靠导致重大安全事故，相关责任人可能面临刑事指控，包括但不限于伪造国家机关证件罪、重大责任事故罪等。
法律建议：
- 立即停止挂靠行为：一旦意识到挂靠行为可能违法，应立即停止，并采取措施消除影响。
- 主动向监管部门报告：如果挂靠行为已经发生，且可能面临监管部门的查处，建议主动向相关部门报告情况，争取从轻或减轻处罚。
- 寻求法律帮助：在处理此类复杂法律问题时，建议咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。
后续行动建议：
- 审查并终止所有非法挂靠协议：确保不再参与任何形式的非法挂靠活动。
- 加强合规管理：对于需要取得许可证的活动，应严格按照法律法规要求申请并取得相应许可证，确保合法经营。
- 定期进行法律风险评估：对于公司运营中的法律风险，应定期进行评估，及时发现并纠正潜在的法律问题。
作为马新丽律师，我专注于合同纠纷和公司事务领域，如果你在此方面有任何法律问题，都可以直接向我咨询。