中标单位违约后，其缴纳的中标保证金并非直接缴入财政，而是需根据合同约定及法律规定进行处理，处理完毕后可能涉及上缴财政的环节，但并非必然。具体分析如下：

1. 保证金的处理原则
   根据《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例，中标单位违约时，招标人有权依据招标文件及合同约定扣除保证金。扣除的保证金通常用于弥补招标人因违约产生的损失，如重新招标费用、工期延误损失等。若保证金不足以覆盖损失，招标人还可要求违约方赔偿差额。

2. 保证金上缴财政的情形
   保证金是否上缴财政需分情况讨论：

   • 政府采购项目：若项目属于政府采购范畴，且招标文件或合同中明确约定违约保证金需上缴国库（如财政专户），则招标人在扣除合理费用后，剩余部分可能按程序上缴财政。但此情形需以书面约定为前提，非法定强制要求。
     
   • 非政府采购项目：对于企业自主招标或非政府采购项目，保证金通常由招标人自行处置，无需上缴财政。招标人可将其用于项目补偿或按内部规定处理。

3. 操作流程与注意事项

   • 合同约定优先：招标文件及合同中应明确保证金的处理方式，包括违约情形下的扣除标准、上缴财政的条件（如有）等。未约定的，招标人无权擅自上缴财政。
     
   • 程序合规性：若需上缴财政，招标人应按财政部门规定履行报批手续，提供违约证明、扣除依据等材料，确保程序合法。
     
   • 避免滥用：招标人不得以违约保证金为名，违规截留或挪用资金，否则可能承担行政或民事责任。

建议：若您是招标方，需在招标文件中明确保证金条款；若您是中标方，可要求招标方出具保证金处理的书面依据。如有具体案例或合同条款需分析，可直接向我咨询。