结论前置：

1. 非法定代表人股东在公司决策、分红上享有权利，但无法直接代表公司。
2. 若公司出现法律问题，非法定代表人股东可能因公司债务承担连带责任（视具体情况而定）。
3. 非法定代表人股东在公司管理中的话语权可能受限。

详细分析如下：

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司的法定代表人只能是一个人，这一规定确保了公司对外代表的唯一性和稳定性。在您所描述的情境中，即公司由两人注册，但法人代表仅为一人时，对于非法定代表人的另一方（我们可称之为“非法定代表人股东”），其可能面临的“坏处”或影响主要体现在以下几个方面：

一、公司决策与代表权的限制

1. 无法直接代表公司：非法定代表人股东虽然作为公司的股东之一，享有参与公司决策、分红等权利，但在对外代表公司、签署文件、参与诉讼等方面，其无法直接行使法定代表人的职权。这可能导致在某些紧急或重要情况下，非法定代表人股东无法及时、有效地代表公司作出决策或采取行动。

2. 决策话语权可能受限：在公司内部决策过程中，虽然非法定代表人股东有权发表意见并参与表决，但如果其持股比例较低或与其他股东存在分歧，其决策话语权可能会受到限制。这可能导致非法定代表人股东在公司发展方向、重大投资等关键问题上的影响力减弱。

二、法律责任与风险的承担

1. 公司债务的连带责任：虽然非法定代表人股东不直接承担公司法定代表人的法律责任，但在某些情况下，如公司出现违法违规行为或债务纠纷时，非法定代表人股东也可能因公司债务而承担连带责任。这主要取决于非法定代表人股东在公司中的持股比例、实际控制权以及是否参与相关违法违规行为等因素。

2. 个人信用与声誉的影响：如果公司因违法违规行为而受到处罚或面临诉讼，这可能会对非法定代表人股东的个人信用和声誉产生负面影响。尤其是在某些行业或领域中，个人信用和声誉对于业务合作、融资等方面具有重要影响。

三、公司管理与运营的挑战

1. 沟通与协调成本增加：在两人注册的公司中，如果法人代表仅为一人，那么非法定代表人股东与法人代表之间的沟通与协调就显得尤为重要。如果双方沟通不畅或存在分歧，可能会导致公司管理效率低下、决策迟缓等问题。

2. 对公司文化的塑造与传承的影响：非法定代表人股东作为公司的重要成员之一，其价值观、经营理念等对公司文化的塑造与传承具有重要影响。如果非法定代表人股东与法人代表在公司文化方面存在分歧或冲突，可能会对公司文化的统一性和稳定性产生不利影响。

建议与总结：

对于非法定代表人股东而言，为了避免或减少上述“坏处”或影响，可以采取以下措施：

• 明确股权结构与决策机制：在注册公司时，应明确股权结构、持股比例以及决策机制等关键问题，确保非法定代表人股东在公司决策中享有足够的权利和话语权。
• 加强沟通与协调：非法定代表人股东应与法人代表保持密切沟通与协调，共同制定公司发展战略、解决公司运营中的问题等。
• 关注公司法律合规：非法定代表人股东应关注公司的法律合规情况，确保公司经营活动符合法律法规要求，避免因违法违规行为而承担法律责任。

有问题可以直接向我咨询，我会结合您的具体情况，给出更详细的法律建议。