针对您在高速公路上因超速被罚款100元并扣3分的情况，以下是我为您提供的详细处理流程和建议：
一、确认违章信息
首先，您需要确认收到的罚款通知或违章信息是否准确无误。这通常包括违章时间、地点、超速比例以及对应的罚款金额和扣分情况。您可以通过当地交通管理部门的官方网站、手机APP或前往交通违法处理窗口进行查询和确认。
二、接受处罚并缴纳罚款
接受处罚：一旦确认违章信息无误，您需要接受这一处罚决定。根据《道路交通安全法》及相关规定，超速行驶是违法行为，应当受到相应的处罚。
缴纳罚款：您需要按照罚款通知上的要求，在规定时间内缴纳罚款。通常，您可以选择通过银行转账、网上支付或前往指定的银行网点进行缴纳。请确保在缴纳罚款时，注明违章信息的编号或相关凭证，以便交通管理部门准确记录和处理。
三、处理扣分
了解扣分情况：根据您的描述，您因超速被扣3分。这意味着您的驾驶证将被记3分，这可能会影响您未来的驾驶资格和保险费用。
参加学习或考试：在某些地区，如果您的驾驶证在一个记分周期内被扣满一定分数（如12分），您可能需要参加交通安全学习或考试来恢复驾驶资格。虽然您目前只被扣了3分，但了解这一规定有助于您更好地管理自己的驾驶行为。
注意记分周期：驾驶证的记分周期通常为12个月，从您初次领取驾驶证的日期开始计算。在记分周期内，如果您的扣分达到或超过12分，将面临更严重的处罚，如吊销驾驶证等。
四、预防未来超速
遵守限速规定：在高速公路上行驶时，务必严格遵守限速规定。不同路段和车道可能有不同的限速要求，请留意路边的限速标志。
使用导航设备：现代导航设备通常具有超速提醒功能，可以帮助您及时了解当前车速和限速情况，避免超速行驶。
定期检查车辆：确保您的车辆性能良好，特别是刹车系统和轮胎等关键部件。良好的车辆性能有助于您在紧急情况下及时减速和停车。
五、咨询与申诉
如果您对处罚决定有异议或认为存在误判情况，您可以向当地交通管理部门提出咨询或申诉。在申诉时，请提供相关证据和理由，以便交通管理部门进行复核和处理。
总之，处理高速公路超速罚款和扣分需要您积极配合交通管理部门的工作，并采取有效措施预防未来超速行为的发生。希望以上建议能对您有所帮助。