检察院没收存在贷款的房产时，会优先保障银行的抵押权，清偿贷款后再进行没收财产的执行程序。以下是对此问题的详细分析：

一. 没收房产与贷款关系处理

1. 没收房产的性质：没收财产是刑罚的一种执行方式，旨在剥夺犯罪分子违法所得的财产以及其他相关财物。当房产被法院认定为犯罪所得并被判决没收时，该房产将归国家所有。

2. 贷款银行的权益：依据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关法律规定，当被没收的房产存在未结清的银行贷款时，需考虑贷款银行的权益。法院在执行没收时，会优先保障银行的抵押权，即先清偿银行贷款，剩余部分再作为没收财产处理。

• 生活实例：例如，某犯罪分子因经济犯罪被判处没收房产，但该房产存在未结清的银行贷款。此时，法院会先组织拍卖房产，所得款项优先用于清偿银行贷款，剩余部分再上缴国库。

二. 贷款清偿与没收程序的协调

1. 查明权属状况：在执行没收前，法院会查明被没收房产的权属状况，包括是否存在贷款、抵押等情况。

2. 通知贷款银行：若房产存在贷款，法院会通知贷款银行，并依据相关法律规定进行协调处理。贷款银行在接到法院通知后，可依法主张其抵押权，要求从被没收房产的变价款中优先受偿。

3. 执行没收程序：在保障银行抵押权的前提下，法院会进行没收财产的执行程序。

三. 特殊情况的处理

1. 房产价值低于贷款总额：若被没收的房产价值低于未结清的银行贷款本息总额，法院可能需与银行协商解决方案，如通过其他途径追缴被告人财产以清偿贷款等。

2. 非法手段获取的贷款：对于被告人通过非法手段获取的贷款或存在其他违法情形的贷款，法院将依法予以处理，并可能追究相关责任人的法律责任。

我的观点：在检察院没收存在贷款的房产时，法律程序既考虑了刑罚的执行，也充分保障了债权人的合法权益。通过优先清偿银行贷款，再执行没收程序，确保了法律的公正性和权威性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。