肇事者认罪认罚后，司法机关将根据案件具体情况，结合认罪认罚的从宽处理原则，依法作出相应处理。具体处理方式如下：

1. 侦查阶段：
   若肇事者在侦查阶段认罪认罚，公安机关会依法记录其认罪态度，并在移送审查起诉时向检察机关提出从宽处理的建议。此时，肇事者可能因认罪态度较好而获得取保候审等非羁押性强制措施的适用机会。

2. 审查起诉阶段：
   检察机关在审查起诉时，会重点审查肇事者的认罪认罚是否自愿、合法，以及是否对被害人进行了赔偿并取得谅解。若符合条件，检察机关可依法提出从宽处罚的量刑建议，包括但不限于建议法院适用缓刑、减轻处罚或从轻处罚。同时，检察机关会与肇事者签署《认罪认罚具结书》，明确其认罪认罚的意愿及法律后果。

3. 审判阶段：
   法院在审理时，会充分考虑肇事者的认罪认罚情节，并结合案件事实、性质、情节及社会危害程度，依法作出判决。若检察机关提出的量刑建议适当，法院一般会采纳。此时，肇事者可能因认罪认罚而获得更轻的刑罚，如有期徒刑的缓刑执行、罚金刑的减轻等。

4. 特殊情形处理：

   • 交通肇事罪中的认罪认罚：若肇事者构成交通肇事罪，且认罪认罚，同时积极赔偿被害人损失并取得谅解，法院可能依法对其从轻处罚，甚至在符合缓刑条件时宣告缓刑。
     
   • 危险驾驶罪中的认罪认罚：对于醉酒驾驶机动车构成危险驾驶罪的，认罪认罚可能成为从轻处罚的重要情节，法院可能据此对其判处更短的拘役期限或更低的罚金。
     
   • 逃逸或情节恶劣的情形：若肇事者在事故后逃逸或存在其他恶劣情节，即使认罪认罚，法院也可能在量刑时予以从严把握，但认罪认罚仍可作为从轻处罚的参考因素。

注意事项：

• 认罪认罚的从宽处理并非“无底线”，司法机关会严格审查其自愿性、合法性及真实性。
  
• 肇事者应积极配合司法机关的调查与审理，如实供述罪行，避免出现翻供或虚假认罪等情形，否则可能影响从宽处理的适用。
  
• 若对量刑建议或判决结果有异议，肇事者及其辩护人可依法提出异议或上诉，但需在法定期限内行使权利。

建议：
若您或他人涉及此类案件，建议及时咨询专业律师，以便更全面地了解认罪认罚的法律后果及从宽处理的适用条件，从而更好地维护自身合法权益。